adenosine deaminase, RNA-specific, B1 (RED1 homolog rat)

同義遺伝子名

ADAR2a, ADARB1, RNA-editing enzyme 1, Double-stranded RNA-specific editase 1, ADAR2c ADAR2d, RNA-editing deaminase 1, dsRNA adenosine deaminase, hRED1, ADAR2, DRABA2, ADAR2a-L1, DRADA2, ADAR2a-L2, ADAR2g, ADAR2a-L3, RED1, RNA-specific, ADAR2b, ADAR2d

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:60.40

小脳:12.60

脳幹:6535.90

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:64.60

動脈:-

静脈:66.60

リンパ節:30.30

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:12.90

骨髄:78.70

脂肪:-

骨:76.80

皮膚:24

GeneChip

大脳:6.93

小脳:8.52

脳幹:7.13

脳梁:4.77

松果体:-

末梢神経:6.34

脊柱:5.99

網膜:-

目:-

動脈:8.29

静脈:7.57

リンパ節:6.72

末梢血:-

脾臓:7.08

胸腺:5.83

骨髄:5.52

脂肪:6.53

骨:-

皮膚:6.46

CAGE

大脳:2.76

小脳:-

脳幹:2.33

脳梁:1.90

松果体:2.79

末梢神経:-

脊柱:2.06

網膜:-

目:-

動脈:4.28

静脈:2.69

リンパ節:2.38

末梢血:-

脾臓:2.46

胸腺:2.12

骨髄:-

脂肪:2.58

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.43

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.72

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.74

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:47.40

前立腺:78.90

卵巣:74.50

精巣:38.90

心臓:127.70

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:25.40

肝臓:168.90

肺:63.50

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:35.60

乳腺:55.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.68

胎盤:6.01

前立腺:7.04

卵巣:6.24

精巣:4.92

心臓:6.18

骨格筋:6.15

食道:5.84

胃:6.69

腸:5.70

結腸:6.20

肝臓:5.50

肺:8.41

膀胱:-

腎臓:5.54

下垂体:5.20

甲状腺:5.43

副腎:6.18

膵臓:4.13

乳腺:6.57

唾液腺:4.88

CAGE

子宮:2.84

胎盤:2.45

前立腺:3.29

卵巣:2.19

精巣:2.16

心臓:2.50

骨格筋:2.90

食道:3.15

胃:-

腸:1.82

結腸:2.50

肝臓:1.69

肺:3.25

膀胱:4.02

腎臓:1.92

下垂体:1.85

甲状腺:1.66

副腎:-

膵臓:1.87

乳腺:2.74

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.83

卵巣:0.24

精巣:0.63

心臓:0.28

骨格筋:0.28

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.30

肝臓:0.04

肺:1.57

膀胱:-

腎臓:0.19

下垂体:-

甲状腺:0.75

副腎:0.91

膵臓:-

乳腺:0.60

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_015834
Gene ID	104
Unigene ID	Hs.474018
Probe set ID	203865_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000197381
GTEx ID	ENSG00000197381

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001024837, NM_130895
ラット[8]	NM_001111055, NM_001111056, NM_001111057, NM_012894

染色体

21q22.3 [46,493,768 - 46,646,478]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001159	Double-stranded RNA binding
IPR014720	Double-stranded RNA-binding-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006382	adenosine to inosine editing
GO:0016553	base conversion or substitution editing
GO:0051607	defense response to virus
GO:0010467	gene expression
GO:0045087	innate immune response
GO:0016556	mRNA modification
GO:0006397	mRNA processing
GO:0030336	negative regulation of cell migration
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0045070	positive regulation of viral genome replication
GO:0051726	regulation of cell cycle
GO:0006396	RNA processing

Cellular Component

GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0004000	adenosine deaminase activity
GO:0003726	double-stranded RNA adenosine deaminase activity
GO:0003725	double-stranded RNA binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0003729	mRNA binding
GO:0003723	RNA binding

adenosine deaminase, RNA-specific, B1 (RED1 homolog rat)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function