tripartite motif-containing 38

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同義遺伝子名

Zinc finger protein RoRet, ring finger protein 15, RORET, RNF15, RING finger protein 15, MGC8946, tripartite motif-containing 38, TRIM38, Tripartite motif-containing protein 38

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:14.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:30 静脈:- リンパ節:80.90 末梢血:145.70 脾臓:170.20 胸腺:90.20 骨髄:19.70 脂肪:121 骨:191.90 皮膚:38.40
GeneChip 大脳:5.47 小脳:5.11 脳幹:5.60 脳梁:5.59 松果体:- 末梢神経:6.17 脊柱:5.67 網膜:- 目:- 動脈:6.34 静脈:6.35 リンパ節:7.62 末梢血:- 脾臓:7.99 胸腺:6.97 骨髄:6.97 脂肪:6.60 骨:- 皮膚:6.46
CAGE 大脳:1.45 小脳:- 脳幹:1.83 脳梁:1.88 松果体:1.76 末梢神経:- 脊柱:2.21 網膜:- 目:- 動脈:3.47 静脈:3.22 リンパ節:3.35 末梢血:- 脾臓:3.39 胸腺:3.15 骨髄:- 脂肪:3.17 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.78 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.29 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.62 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:109.40 胎盤:47.40 前立腺:90.10 卵巣:149.10 精巣:8.70 心臓:38.30 骨格筋:20.10 食道:- 胃:42.50 腸:129.60 結腸:84.80     肝臓:31.70        肺:112.40    膀胱:125.60 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:- 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.67 胎盤:6.34 前立腺:6.87 卵巣:6.48 精巣:5.61 心臓:5.98 骨格筋:5.53 食道:6.40 胃:6.47 腸:6.12 結腸:6.20 肝臓:6.57 肺:7.05 膀胱:- 腎臓:6.50 下垂体:5.71 甲状腺:6.71 副腎:6.91 膵臓:5.01 乳腺:7.15 唾液腺:6.17
CAGE 子宮:3.67 胎盤:2.86 前立腺:3.35 卵巣:3.01 精巣:2.25 心臓:2.43 骨格筋:2.44 食道:3.27 胃:- 腸:3.19 結腸:2.95     肝臓:2.45    肺:3.13 膀胱:3.46 腎臓:3.74 下垂体:2.06 甲状腺:3.10 副腎:- 膵臓:2.08 乳腺:2.27 唾液腺:2.99
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.36 卵巣:2.71 精巣:2.31 心臓:1.40 骨格筋:1.96 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.45     肝臓:1.86        肺:3.28    膀胱:- 腎臓:3.89 下垂体:- 甲状腺:2.90 副腎:3.38 膵臓:- 乳腺:2.46 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006355
Gene ID 10475
Unigene ID Hs.584851
Probe set ID 203568_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000112343
GTEx ID ENSG00000112343

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001029935
ラット[1]  NM_001029935

染色体

6p22.2  [25,963,030  -  25,985,348]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870  B302 (SPRY)-like
IPR003879  Butyrophylin-like
IPR003877  SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355  SPla/RYanodine receptor subgroup
IPR000315  Zinc finger, B-box

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9149941
11331580
11854271
12477932
12761501
15489334
16344560
18248090
19084217
19322201
19690564
21143188
21306652
21348951
21789858
21963094
21988832
22323536
22505724
23056470
23275563
24434549

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0050687  negative regulation of defense response to virus
GO:0043123  positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0045070  positive regulation of viral genome replication
GO:0043161  proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
GO:0070936  protein K48-linked ubiquitination
GO:0032648  regulation of interferon-beta production
GO:0007165  signal transduction

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component
GO:0005622  intracellular

Molecular Function

GO:0004871  signal transducer activity
GO:0008270  zinc ion binding