sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6C

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同義遺伝子名

m-Sema Y, m-Sema Y2, SEMA6C, Semaphorin-6C precursor, KIAA1869, Semaphorin Y, SEMAY, Sema Y

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:29.60 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:- 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:24
GeneChip 大脳:6.90 小脳:7.21 脳幹:6.88 脳梁:6.85 松果体:- 末梢神経:6.59 脊柱:6.51 網膜:- 目:- 動脈:6.59 静脈:7.11 リンパ節:6.66 末梢血:- 脾臓:6.48 胸腺:6.35 骨髄:6.78 脂肪:6.80 骨:- 皮膚:6.57
CAGE 大脳:2.54 小脳:- 脳幹:1.89 脳梁:1.95 松果体:1.44 末梢神経:- 脊柱:1.65 網膜:- 目:- 動脈:2.12 静脈:2.64 リンパ節:2.40 末梢血:- 脾臓:0.95 胸腺:1.26 骨髄:- 脂肪:2.47 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.96 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.28 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.08 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:56.20 心臓:25.50 骨格筋:80.40 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:17     肝臓:-        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.61 胎盤:6.52 前立腺:6.11 卵巣:6.65 精巣:6.67 心臓:7.26 骨格筋:7.79 食道:7.01 胃:6.82 腸:7.08 結腸:7.10 肝臓:7.05 肺:6.81 膀胱:- 腎臓:7.09 下垂体:6.81 甲状腺:6.54 副腎:6.77 膵臓:7.25 乳腺:6.55 唾液腺:7.03
CAGE 子宮:2.68 胎盤:1.08 前立腺:2.27 卵巣:2.39 精巣:4.07 心臓:3.58 骨格筋:5.12 食道:2.27 胃:- 腸:2.27 結腸:2.16     肝臓:0.96    肺:1.93 膀胱:2.14 腎臓:1.80 下垂体:2.35 甲状腺:1.78 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:2.47 唾液腺:1.28
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.82 卵巣:1.87 精巣:2.56 心臓:3.19 骨格筋:1.89 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.38     肝臓:0.28        肺:0.81    膀胱:- 腎臓:1.00 下垂体:- 甲状腺:1.74 副腎:1.71 膵臓:- 乳腺:1.82 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_030913
Gene ID 10500
Unigene ID Hs.516316
Probe set ID 208100_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000143434
GTEx ID ENSG00000143434

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_011351
ラット[1]  NM_017308

染色体

1q21.3  [151,104,161  -  151,119,104]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8619474
9110174
11245885
11347906
12110693
12477932
12878157
16344560
16710414
19054571

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0004872  receptor activity
GO:0030215  semaphorin receptor binding