sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4D

同義遺伝子名

coll-4, SEMAJ, BB18, M-sema G, M-sema-G, GR3, Semaphorin-4D precursor, SEMA4D, Leukocyte activation antigen CD100, A8, CD100

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:88.90

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:296.70

末梢神経:30.70

脊柱:224.60

網膜:118.60

目:70.50

動脈:-

静脈:-

リンパ節:252.80

末梢血:109.30

脾臓:18.90

胸腺:77.30

骨髄:157.40

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:38.40

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.88

小脳:-

脳幹:4.73

脳梁:5.39

松果体:2.62

末梢神経:-

脊柱:4.79

網膜:-

目:-

動脈:2.53

静脈:4.24

リンパ節:4.35

末梢血:-

脾臓:3.96

胸腺:4.46

骨髄:-

脂肪:2.10

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.62

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.56

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.30

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:25.50

前立腺:146.40

卵巣:-

精巣:43.30

心臓:-

骨格筋:60.30

食道:-

胃:21.20

腸:64.80

結腸:93.30

肝臓:10.60

肺:48.90

膀胱:-

腎臓:83.20

下垂体:-

甲状腺:327.50

副腎:101.60

膵臓:44.50

乳腺:37.20

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:2.63

胎盤:2.37

前立腺:2.64

卵巣:2.45

精巣:2.60

心臓:2.37

骨格筋:3.09

食道:2.60

胃:-

腸:2.62

結腸:2.72

肝臓:1.60

肺:3.20

膀胱:2.50

腎臓:3.50

下垂体:2.84

甲状腺:2.73

副腎:-

膵臓:2.41

乳腺:2.47

唾液腺:2.99

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.78

卵巣:1.42

精巣:1.58

心臓:1.83

骨格筋:4.11

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.48

肝臓:0.17

肺:0.47

膀胱:-

腎臓:2.01

下垂体:-

甲状腺:1.49

副腎:1.44

膵臓:-

乳腺:0.80

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001142287
Gene ID	10507
Unigene ID	Hs.494406
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000187764
GTEx ID	ENSG00000187764

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_013660
ラット [0]

染色体

9q22.2 [91,975,702 - 92,113,045]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659	Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627	Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007411	axon guidance
GO:0007155	cell adhesion
GO:0006955	immune response
GO:0070486	leukocyte aggregation
GO:0010693	negative regulation of alkaline phosphatase activity
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0045668	negative regulation of osteoblast differentiation
GO:0050732	negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0043931	ossification involved in bone maturation
GO:0030335	positive regulation of cell migration
GO:0048672	positive regulation of collateral sprouting
GO:0050731	positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
GO:0014068	positive regulation of phosphoinositide 3-kinase cascade
GO:0001934	positive regulation of protein amino acid phosphorylation
GO:0032321	positive regulation of Rho GTPase activity
GO:0031344	regulation of cell projection organization
GO:0008360	regulation of cell shape
GO:0048814	regulation of dendrite morphogenesis

Cellular Component

GO:0005615	extracellular space
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0004872	receptor activity
GO:0005102	receptor binding
GO:0030215	semaphorin receptor binding
GO:0004888	transmembrane receptor activity