serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 1

同義遺伝子名

SPTI, HSAN, Serine palmitoyltransferase 1, HSAN1, SPT1, HSN1, LCB1, LBC1, MGC14645, Serine-palmitoyl-CoA transferase 1, SPTLC1, Long chain base biosynthesis protein 1, LCB 1, SPT 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:118.50

小脳:63

脳幹:-

脳梁:408.30

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:237.30

目:88.20

動脈:329.70

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:54.70

脾臓:605

胸腺:90.20

骨髄:78.70

脂肪:40.30

骨:102.40

皮膚:115.20

GeneChip

大脳:5.17

小脳:5.08

脳幹:5.30

脳梁:5.21

松果体:-

末梢神経:5.04

脊柱:5.34

網膜:-

目:-

動脈:4.85

静脈:4.94

リンパ節:4.53

末梢血:-

脾臓:4.81

胸腺:5.48

骨髄:4.86

脂肪:5.15

骨:-

皮膚:5.43

CAGE

大脳:2.30

小脳:-

脳幹:2.64

脳梁:2.65

松果体:2.38

末梢神経:-

脊柱:2.68

網膜:-

目:-

動脈:1.91

静脈:1.61

リンパ節:2.27

末梢血:-

脾臓:1.50

胸腺:1.80

骨髄:-

脂肪:2.30

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.47

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.58

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.63

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:100.20

胎盤:131.10

前立腺:45.10

卵巣:-

精巣:116.80

心臓:51.10

骨格筋:40.20

食道:342.80

胃:42.50

腸:-

結腸:440.90

肝臓:84.40

肺:117.30

膀胱:-

腎臓:83.20

下垂体:347.90

甲状腺:327.50

副腎:152.40

膵臓:35.60

乳腺:74.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.69

胎盤:5.99

前立腺:5.82

卵巣:5.70

精巣:5.62

心臓:5.01

骨格筋:4.74

食道:6.15

胃:4.98

腸:5.40

結腸:5.25

肝臓:4.32

肺:4.84

膀胱:-

腎臓:4.87

下垂体:5.17

甲状腺:5.06

副腎:4.69

膵臓:5.42

乳腺:4.97

唾液腺:4.87

CAGE

子宮:2.62

胎盤:2.89

前立腺:2.32

卵巣:3.17

精巣:2.89

心臓:1.71

骨格筋:1.61

食道:2.74

胃:-

腸:2.49

結腸:2.05

肝臓:2.14

肺:2.04

膀胱:2.12

腎臓:2.50

下垂体:2.66

甲状腺:2.66

副腎:-

膵臓:2.08

乳腺:2.53

唾液腺:1.58

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.06

卵巣:5.18

精巣:4.81

心臓:3.29

骨格筋:2.89

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.76

肝臓:2.88

肺:4.60

膀胱:-

腎臓:5.04

下垂体:-

甲状腺:5.04

副腎:4.38

膵臓:-

乳腺:4.85

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006415
Gene ID	10558
Unigene ID	Hs.90458
Probe set ID	202278_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000090054
GTEx ID	ENSG00000090054

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_009269
ラット[1]	NM_001108406

染色体

9q22.31 [94,793,427 - 94,877,690]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0046513	ceramide biosynthetic process
GO:0046511	sphinganine biosynthetic process
GO:0030148	sphingolipid biosynthetic process
GO:0006665	sphingolipid metabolic process
GO:0006686	sphingomyelin biosynthetic process
GO:0046512	sphingosine biosynthetic process

GO:0005789	endoplasmic reticulum membrane
GO:0016021	integral to membrane
GO:0017059	serine C-palmitoyltransferase complex

GO:0005515	protein binding
GO:0030170	pyridoxal phosphate binding
GO:0004758	serine C-palmitoyltransferase activity

serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function