SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

hSlu7, SLU7, MGC9280, step II splicing factor SLU7

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:85.30 小脳:63 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:47 動脈:30 静脈:- リンパ節:80.90 末梢血:18.20 脾臓:56.70 胸腺:51.50 骨髄:19.70 脂肪:161.30 骨:64 皮膚:57.60
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.79 小脳:- 脳幹:4.06 脳梁:3.47 松果体:3.83 末梢神経:- 脊柱:4.08 網膜:- 目:- 動脈:3.45 静脈:3.22 リンパ節:3.24 末梢血:- 脾臓:3.63 胸腺:3.59 骨髄:- 脂肪:3.76 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.77 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.48 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.91 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:72.90 胎盤:58.30 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:90.90 心臓:63.90 骨格筋:40.20 食道:- 胃:- 腸:129.60 結腸:76.30     肝臓:84.40        肺:48.90    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.31 胎盤:3.59 前立腺:3.60 卵巣:3.41 精巣:3.66 心臓:3.59 骨格筋:4.03 食道:3.46 胃:- 腸:3.58 結腸:3.03     肝臓:3.27    肺:3.50 膀胱:3.77 腎臓:3.65 下垂体:3.73 甲状腺:3.81 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:2.91 唾液腺:2.53
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.05 卵巣:3.64 精巣:4.88 心臓:3.57 骨格筋:4.35 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.03     肝臓:2.68        肺:3.49    膀胱:- 腎臓:3.53 下垂体:- 甲状腺:4.77 副腎:3.91 膵臓:- 乳腺:4.24 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006425
Gene ID 10569
Unigene ID Hs.435342
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000164609
GTEx ID ENSG00000164609

オーソログ対応遺伝子

マウス[10]  NM_148673, NM_198936
ラット[1]  NM_001100550, NM_198936

染色体

5q33.3  [159,828,648  -  159,848,718]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10197984
10647016
11238888
11991638
12477932
15181151
15728250
16159877
16189514
16344560
17804646
18029348
18662664
18854154
19369195
19946888
21122810
21693764
21890473
21906983
21963094
22365833
22505724
22939629
23455924
23754748
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000380  alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0033554  cellular response to stress
GO:0006886  intracellular protein transport
GO:0000389  nuclear mRNA 3'-splice site recognition
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000375  RNA splicing, via transesterification reactions

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005737  cytoplasm
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0016607  nuclear speck
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0030532  small nuclear ribonucleoprotein complex
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0030628  pre-mRNA 3'-splice site binding
GO:0000386  second spliceosomal transesterification activity
GO:0008270  zinc ion binding