polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide F, 39 kDa

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

RNA polymerase III C39 subunit, DNA-directed RNA polymerase III 39 kDa polypeptide, RPC6, DNA-directed RNA polymerase III subunit F, RPC39, POLR3F, MGC13517

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:28.40 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:58.30 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:224.60 網膜:- 目:29.40 動脈:30 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:54.70 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:38.40 皮膚:57.60
GeneChip 大脳:4.60 小脳:4.97 脳幹:4.57 脳梁:4.43 松果体:- 末梢神経:4.60 脊柱:4.60 網膜:- 目:- 動脈:4.34 静脈:4.24 リンパ節:4.24 末梢血:- 脾臓:4.19 胸腺:4.41 骨髄:4.03 脂肪:4.30 骨:- 皮膚:4.39
CAGE 大脳:3.27 小脳:- 脳幹:3.08 脳梁:2.94 松果体:3.62 末梢神経:- 脊柱:3.11 網膜:- 目:- 動脈:2.36 静脈:2.62 リンパ節:2.58 末梢血:- 脾臓:2.62 胸腺:2.47 骨髄:- 脂肪:2.65 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.23 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.16 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.33 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:29.10 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:21.60 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:-     肝臓:21.10        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:232 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:- 乳腺:111.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.53 胎盤:4.40 前立腺:4.35 卵巣:4.49 精巣:4.55 心臓:4.30 骨格筋:4.42 食道:4.24 胃:4.23 腸:4.15 結腸:4.02 肝臓:3.95 肺:4.08 膀胱:- 腎臓:4.21 下垂体:4.68 甲状腺:4.37 副腎:4.17 膵臓:3.81 乳腺:4.54 唾液腺:4.22
CAGE 子宮:2.86 胎盤:2.38 前立腺:2.67 卵巣:2.65 精巣:2.91 心臓:2.74 骨格筋:2.51 食道:2.37 胃:- 腸:2.11 結腸:2.11     肝臓:2.03    肺:2.53 膀胱:2.67 腎臓:2.63 下垂体:3.07 甲状腺:2.60 副腎:- 膵臓:2.41 乳腺:2.64 唾液腺:2.43
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.90 卵巣:3.13 精巣:3.37 心臓:2.10 骨格筋:1.67 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.64     肝臓:1.98        肺:1.42    膀胱:- 腎臓:2.89 下垂体:- 甲状腺:3.39 副腎:3.15 膵臓:- 乳腺:2.90 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006466
Gene ID 10621
Unigene ID Hs.472227
Probe set ID 205218_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000132664
GTEx ID ENSG00000132664

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_029763
ラット[1]  NM_001107784

染色体

20p11.23  [18,447,771  -  18,465,287]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR007832  RNA polymerase Rpc34
IPR016049  RNA polymerase Rpc34-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1403646
8125298
8889549
9171375
10523658
10623476
11780052
12391170
12477932
14702039
15489334
16169070
16344560
17612402
18187620
19322201
19631370
20888865
21139048
21963094
21988832
22939629
23000965
23455924

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051607  defense response to virus
GO:0010467  gene expression
GO:0045087  innate immune response
GO:0045089  positive regulation of innate immune response
GO:0032728  positive regulation of interferon-beta production
GO:0032481  positive regulation of type I interferon production
GO:0006359  regulation of transcription from RNA polymerase III promoter
GO:0006385  RNA elongation from RNA polymerase III promoter
GO:0006386  termination of RNA polymerase III transcription
GO:0006383  transcription from RNA polymerase III promoter

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0005666  DNA-directed RNA polymerase III complex
GO:0005654  nucleoplasm

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0003899  DNA-directed RNA polymerase activity
GO:0005515  protein binding