tripartite motif-containing 16

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同義遺伝子名

tripartite motif-containing 16, Tripartite motif-containing protein 16, Estrogen-responsive B box protein, TRIM16, EBBP

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:35.60 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:116.60 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:119.90 静脈:- リンパ節:- 末梢血:18.20 脾臓:37.80 胸腺:38.70 骨髄:19.70 脂肪:121 骨:76.80 皮膚:129.60
GeneChip 大脳:5.64 小脳:5.61 脳幹:5.77 脳梁:6.07 松果体:- 末梢神経:6.09 脊柱:6.27 網膜:- 目:- 動脈:5.64 静脈:6.28 リンパ節:6.27 末梢血:- 脾臓:5.31 胸腺:5.69 骨髄:5.92 脂肪:6.07 骨:- 皮膚:6.69
CAGE 大脳:1.69 小脳:- 脳幹:2.25 脳梁:1.76 松果体:1.49 末梢神経:- 脊柱:1.98 網膜:- 目:- 動脈:1.65 静脈:1.17 リンパ節:1.99 末梢血:- 脾臓:1.09 胸腺:1.44 骨髄:- 脂肪:1.66 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.17 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.65 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.07 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:47.40 前立腺:45.10 卵巣:37.30 精巣:8.70 心臓:25.50 骨格筋:40.20 食道:342.80 胃:42.50 腸:- 結腸:67.80     肝臓:10.60        肺:63.50    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:152.40 膵臓:35.60 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.91 胎盤:6.79 前立腺:5.07 卵巣:5.82 精巣:5.81 心臓:5.91 骨格筋:6.11 食道:8.63 胃:6.08 腸:6.16 結腸:6.05 肝臓:5.26 肺:6.02 膀胱:- 腎臓:5.48 下垂体:5.17 甲状腺:5.80 副腎:6.18 膵臓:5.87 乳腺:6.20 唾液腺:5.76
CAGE 子宮:1.60 胎盤:2.05 前立腺:1.30 卵巣:1.08 精巣:1.53 心臓:1.20 骨格筋:1.14 食道:2.31 胃:- 腸:0.93 結腸:1.69     肝臓:0.71    肺:1.25 膀胱:1.73 腎臓:1.19 下垂体:1.02 甲状腺:1.23 副腎:- 膵臓:1.42 乳腺:1.53 唾液腺:1.39
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.14 卵巣:2.08 精巣:2.32 心臓:2.07 骨格筋:2.13 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.95     肝臓:0.88        肺:2.87    膀胱:- 腎臓:2.75 下垂体:- 甲状腺:4.13 副腎:2.64 膵臓:- 乳腺:3.57 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_006470
Gene ID 10626
Unigene ID Hs.123534
Probe set ID 204341_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000221926
GTEx ID ENSG00000221926

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_053169
ラット[1]  NM_001135033

染色体

17p12  [15,531,274  -  15,587,613]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870  B302 (SPRY)-like
IPR003879  Butyrophylin-like
IPR003877  SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355  SPla/RYanodine receptor subgroup
IPR000315  Zinc finger, B-box

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9817599
11331580
11919186
12477932
14702039
15302935
15489334
16079077
16169070
16575408
16636064
18029348
19147277
20729920
21044950
21832049
21963094
22629402
22863883
23404198
23422002

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043966  histone H3 acetylation
GO:0043967  histone H4 acetylation
GO:0050718  positive regulation of interleukin-1 beta secretion
GO:0045618  positive regulation of keratinocyte differentiation
GO:0048386  positive regulation of retinoic acid receptor signaling pathway
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0060416  response to growth hormone stimulus
GO:0046683  response to organophosphorus
GO:0032526  response to retinoic acid

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0016605  PML body

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0019966  interleukin-1 binding
GO:0032089  NACHT domain binding
GO:0005515  protein binding
GO:0008270  zinc ion binding