CCCTC-binding factor (zinc finger protein)

同義遺伝子名

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, CCCTC-binding factor (zinc finger protein), 11-zinc finger protein, CCCTC-binding factor, CTCFL paralog

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:61.60

小脳:50.40

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:11.80

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:101.10

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:128.80

骨髄:118.10

脂肪:-

骨:-

皮膚:43.20

GeneChip

大脳:7.08

小脳:7.50

脳幹:6.96

脳梁:7.24

松果体:-

末梢神経:6.99

脊柱:6.96

網膜:-

目:-

動脈:7.17

静脈:6.85

リンパ節:7.65

末梢血:-

脾臓:7.57

胸腺:8.85

骨髄:7.68

脂肪:7.10

骨:-

皮膚:7.29

CAGE

大脳:3.98

小脳:-

脳幹:3.79

脳梁:3.97

松果体:4.08

末梢神経:-

脊柱:4.03

網膜:-

目:-

動脈:3.73

静脈:4.20

リンパ節:4.02

末梢血:-

脾臓:4.11

胸腺:4.94

骨髄:-

脂肪:3.77

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.44

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.88

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.61

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:145.80

胎盤:10.90

前立腺:56.30

卵巣:37.30

精巣:64.90

心臓:38.30

骨格筋:20.10

食道:-

胃:21.20

腸:32.40

結腸:76.30

肝臓:21.10

肺:39.10

膀胱:-

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:62.20

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.64

胎盤:7.39

前立腺:7.60

卵巣:7.57

精巣:6.89

心臓:6.81

骨格筋:7.25

食道:7.28

胃:7.16

腸:7.14

結腸:7.08

肝臓:6.81

肺:7.15

膀胱:-

腎臓:7.06

下垂体:6.97

甲状腺:7.31

副腎:7.04

膵臓:6.19

乳腺:7.38

唾液腺:7.01

CAGE

子宮:4.04

胎盤:4.00

前立腺:3.95

卵巣:3.99

精巣:3.58

心臓:3.75

骨格筋:3.88

食道:3.85

胃:-

腸:3.81

結腸:3.88

肝臓:3.42

肺:3.78

膀胱:3.93

腎臓:3.73

下垂体:3.89

甲状腺:3.57

副腎:-

膵臓:3.78

乳腺:3.64

唾液腺:3.52

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.93

卵巣:4.84

精巣:3.73

心臓:3.20

骨格筋:3.66

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.85

肝臓:2.42

肺:3.18

膀胱:-

腎臓:3.43

下垂体:-

甲状腺:3.90

副腎:3.94

膵臓:-

乳腺:3.42

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006565
Gene ID	10664
Unigene ID	Hs.368367
Probe set ID	202521_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000102974
GTEx ID	ENSG00000102974

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_181322
ラット[1]	NM_031824

染色体

16q22.1 [67,596,310 - 67,673,086]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015880	Zinc finger, C2H2-like
IPR007087	Zinc finger, C2H2-type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0007059	chromosome segregation
GO:0006349	genetic imprinting
GO:0010216	maintenance of DNA methylation
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0016584	nucleosome positioning
GO:0010628	positive regulation of gene expression
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0070602	regulation of centromeric sister chromatid cohesion
GO:0040029	regulation of gene expression, epigenetic
GO:0035065	regulation of histone acetylation
GO:0031060	regulation of histone methylation
GO:0040030	regulation of molecular function, epigenetic
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000775	chromosome, centromeric region
GO:0000793	condensed chromosome
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0043035	chromatin insulator sequence binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008270	zinc ion binding

CCCTC-binding factor (zinc finger protein)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function