SIX homeobox 2

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同義遺伝子名

sine oculis homeobox (Drosophila) homolog 2, Sine oculis homeobox homolog 2, sine oculis homeobox homolog 2 (Drosophila), SIX2, Homeobox protein SIX2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.44 小脳:4.06 脳幹:4.73 脳梁:4.18 松果体:- 末梢神経:4.63 脊柱:4.31 網膜:- 目:- 動脈:5.05 静脈:4.68 リンパ節:4.14 末梢血:- 脾臓:4.15 胸腺:5.37 骨髄:4.46 脂肪:5.25 骨:- 皮膚:4.66
CAGE 大脳:0.17 小脳:- 脳幹:0.35 脳梁:0.18 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0.23 網膜:- 目:- 動脈:1.88 静脈:0.47 リンパ節:0.28 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:1.26 骨髄:- 脂肪:1.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.12 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.80 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.28 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.63 胎盤:4.04 前立腺:4.92 卵巣:4.30 精巣:4.22 心臓:4.91 骨格筋:5.72 食道:4.68 胃:5.35 腸:4.91 結腸:4.50 肝臓:4.51 肺:4.24 膀胱:- 腎臓:4.44 下垂体:5.93 甲状腺:4.23 副腎:4.35 膵臓:5.12 乳腺:4.39 唾液腺:7.08
CAGE 子宮:1.11 胎盤:0.24 前立腺:1.56 卵巣:0.14 精巣:0.44 心臓:0.56 骨格筋:1.75 食道:0.40 胃:- 腸:0 結腸:0.12     肝臓:0    肺:0.39 膀胱:0.58 腎臓:0.21 下垂体:2.06 甲状腺:0.37 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:1.53 唾液腺:2.88
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.26 卵巣:0.04 精巣:1.17 心臓:0.32 骨格筋:3.41 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.61     肝臓:0        肺:0.85    膀胱:- 腎臓:0.29 下垂体:- 甲状腺:2.68 副腎:0.44 膵臓:- 乳腺:0.93 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016932
Gene ID 10736
Unigene ID Hs.101937
Probe set ID 206510_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000170577
GTEx ID ENSG00000170577

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011380
ラット [0]  

染色体

2p21  [45,232,343  -  45,236,543]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8814301
10677303
10773454
11734542
12215533
12441302
12477932
18305125
18989625
19055944
20542577
21832049
21909109
22703800

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009653  anatomical structure morphogenesis
GO:0008283  cell proliferation
GO:0002062  chondrocyte differentiation
GO:0048701  embryonic cranial skeleton morphogenesis
GO:0001822  kidney development
GO:0003337  mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis
GO:0007501  mesodermal cell fate specification
GO:0042474  middle ear morphogenesis
GO:0045596  negative regulation of cell differentiation
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006606  protein import into nucleus

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0032403  protein complex binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity