cleavage and polyadenylation specific factor 4, 30kDa

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

NEB1, CPSF30, Neb-1, CPSF 30 kDa subunit, CPSF4, NAR, No arches homolog, NS1 effector domain-binding protein 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:32 小脳:100.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:52.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:80.90 末梢血:36.40 脾臓:18.90 胸腺:38.70 骨髄:19.70 脂肪:80.70 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:7.25 小脳:7.53 脳幹:7.17 脳梁:7.33 松果体:- 末梢神経:7.21 脊柱:7.28 網膜:- 目:- 動脈:7.42 静脈:7.26 リンパ節:7.52 末梢血:- 脾臓:7.36 胸腺:7.43 骨髄:7.34 脂肪:7.38 骨:- 皮膚:7.44
CAGE 大脳:2.18 小脳:- 脳幹:2.16 脳梁:2.45 松果体:1.55 末梢神経:- 脊柱:2.81 網膜:- 目:- 動脈:2.05 静脈:1.61 リンパ節:2.23 末梢血:- 脾臓:1.34 胸腺:1.52 骨髄:- 脂肪:1.95 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.17 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.38 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.51 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:82 胎盤:61.90 前立腺:22.50 卵巣:37.30 精巣:43.30 心臓:127.70 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:10.60        肺:44    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:62.20 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.29 胎盤:6.93 前立腺:7.38 卵巣:7.34 精巣:7.74 心臓:7.15 骨格筋:7.54 食道:7.40 胃:7.23 腸:7.35 結腸:7.27 肝臓:7.25 肺:7.32 膀胱:- 腎臓:7.26 下垂体:7.35 甲状腺:7.40 副腎:7.34 膵臓:7.87 乳腺:7.60 唾液腺:7.61
CAGE 子宮:1.84 胎盤:1.89 前立腺:1.70 卵巣:1.46 精巣:3.12 心臓:1.88 骨格筋:2.08 食道:1.48 胃:- 腸:1.66 結腸:2.02     肝臓:1.29    肺:1.46 膀胱:1.45 腎臓:1.51 下垂体:1.90 甲状腺:1.82 副腎:- 膵臓:2.26 乳腺:2.02 唾液腺:1.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.23 卵巣:2.26 精巣:2.40 心臓:1.55 骨格筋:3.24 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.64     肝臓:0.77        肺:2.37    膀胱:- 腎臓:1.35 下垂体:- 甲状腺:1.85 副腎:2.69 膵臓:- 乳腺:1.99 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006693
Gene ID 10898
Unigene ID Hs.489287
Probe set ID 206688_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000160917
GTEx ID ENSG00000160917

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_178576
ラット [0]  

染色体

7q22.1  [99,036,545  -  99,054,994]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001878  Zinc finger, CCHC-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7969155
8302877
8889549
9002523
9224719
9651582
11060040
12477932
12690205
14749727
15489334
16169070
16189514
16341674
17207965
17522219
18029348
19136632
19913121
20628086
21139048
21822216
22990118
23602568

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0046778  modification by virus of host mRNA processing
GO:0019054  modulation by virus of host cellular process
GO:0006397  mRNA processing
GO:0019058  viral infectious cycle
GO:0019048  virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion
GO:0005847  mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex
GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003723  RNA binding
GO:0008270  zinc ion binding