RNA binding protein S1, serine-rich domain

同義遺伝子名

MGC117332, RNPS1, RNA binding protein S1, serine-rich domain, SR-related protein LDC2, E5.1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, LDC2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:104.30

小脳:138.50

脳幹:6535.90

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:122.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:117.50

動脈:30

静脈:-

リンパ節:60.70

末梢血:91.10

脾臓:56.70

胸腺:51.50

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:140.70

皮膚:163.20

GeneChip

大脳:9.30

小脳:9.52

脳幹:9.25

脳梁:8.93

松果体:-

末梢神経:9.14

脊柱:8.97

網膜:-

目:-

動脈:8.97

静脈:8.87

リンパ節:9.31

末梢血:-

脾臓:9.55

胸腺:9.49

骨髄:9.06

脂肪:8.82

骨:-

皮膚:9.02

CAGE

大脳:1.92

小脳:-

脳幹:1.80

脳梁:1.81

松果体:1.85

末梢神経:-

脊柱:1.42

網膜:-

目:-

動脈:1.68

静脈:1.34

リンパ節:1.63

末梢血:-

脾臓:1.83

胸腺:1.82

骨髄:-

脂肪:1.66

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.45

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.45

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.54

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:91.10

胎盤:102

前立腺:157.70

卵巣:74.50

精巣:73.50

心臓:114.90

骨格筋:-

食道:-

胃:63.70

腸:64.80

結腸:50.90

肝臓:95

肺:92.90

膀胱:-

腎臓:62.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:133.40

乳腺:176.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:9.15

胎盤:8.76

前立腺:9.29

卵巣:9.24

精巣:10.24

心臓:8.77

骨格筋:8.88

食道:9.06

胃:8.98

腸:8.91

結腸:9.13

肝臓:8.31

肺:9.03

膀胱:-

腎臓:8.91

下垂体:9.46

甲状腺:9.38

副腎:9.18

膵臓:8.34

乳腺:9.33

唾液腺:8.59

CAGE

子宮:1.46

胎盤:1.92

前立腺:1.44

卵巣:1.59

精巣:3.18

心臓:1.30

骨格筋:1.82

食道:1.75

胃:-

腸:1.41

結腸:0.91

肝臓:1.71

肺:1.45

膀胱:1.49

腎臓:1.58

下垂体:1.86

甲状腺:1.59

副腎:-

膵臓:1.59

乳腺:1.16

唾液腺:1.15

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.34

卵巣:4.62

精巣:5.44

心臓:3.00

骨格筋:4.32

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.38

肝臓:0.35

肺:3.60

膀胱:-

腎臓:2.28

下垂体:-

甲状腺:4.54

副腎:3.76

膵臓:-

乳腺:1.69

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_080594
Gene ID	10921
Unigene ID	Hs.355643
Probe set ID	200060_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000205937
GTEx ID	ENSG00000205937

オーソログ対応遺伝子

マウス[12]	NM_001080127, NM_001080128, NM_009070
ラット[1]	NM_001011890, NM_001080128, NM_009070

染色体

16p13.3 [2,303,117 - 2,318,379]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0031124	mRNA 3'-end processing
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000184	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006369	termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0035145	exon-exon junction complex
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003730	mRNA 3'-UTR binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

RNA binding protein S1, serine-rich domain

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function