apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 2

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同義遺伝子名

ARCD1, APOBEC2, Probable C->U-editing enzyme APOBEC-2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:30 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:121 骨:- 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:5.34 小脳:5.33 脳幹:5.45 脳梁:5.16 松果体:- 末梢神経:5.27 脊柱:5.16 網膜:- 目:- 動脈:5.55 静脈:5.66 リンパ節:5.20 末梢血:- 脾臓:4.90 胸腺:5.60 骨髄:5.65 脂肪:5.45 骨:- 皮膚:5.99
CAGE 大脳:0 小脳:- 脳幹:0 脳梁:0 松果体:0.56 末梢神経:- 脊柱:0 網膜:- 目:- 動脈:0.18 静脈:2.54 リンパ節:1.30 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:1.38 骨髄:- 脂肪:1.60 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:10.90 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:- 心臓:229.90 骨格筋:984.40 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:10.60        肺:39.10    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:62.20 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.03 胎盤:5.17 前立腺:5.01 卵巣:5.11 精巣:5.50 心臓:7.52 骨格筋:10.78 食道:6.99 胃:5.74 腸:6.35 結腸:5.36 肝臓:5.28 肺:5.10 膀胱:- 腎臓:5.16 下垂体:5.18 甲状腺:4.99 副腎:5.32 膵臓:6.02 乳腺:5.01 唾液腺:5.43
CAGE 子宮:0 胎盤:0 前立腺:0.66 卵巣:0 精巣:0.52 心臓:4.32 骨格筋:5.77 食道:2.12 胃:- 腸:0.33 結腸:0.08     肝臓:0    肺:0 膀胱:0.40 腎臓:0 下垂体:0 甲状腺:0.93 副腎:- 膵臓:2.86 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.34 卵巣:0.10 精巣:2.08 心臓:6.15 骨格筋:6.23 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.38     肝臓:0.10        肺:0.21    膀胱:- 腎臓:0.06 下垂体:- 甲状腺:4.59 副腎:0.37 膵臓:- 乳腺:3.97 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006789
Gene ID 10930
Unigene ID Hs.555915
Probe set ID 206160_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000124701
GTEx ID ENSG00000124701

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_009694
ラット [0]  

染色体

6p21.1  [41,021,043  -  41,032,465]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8078915
8125298
8999814
10403781
11698249
12477932
12683974
14574404
15489334
17187054
18974842
19911124
20138841
21469143

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0009972  cytidine deamination
GO:0080111  DNA demethylation
GO:0016556  mRNA modification
GO:0006397  mRNA processing

Molecular Function

GO:0004126  cytidine deaminase activity
GO:0003723  RNA binding
GO:0008270  zinc ion binding