chromodomain helicase DNA binding protein 4

同義遺伝子名

Mi-2b, Mi-2 autoantigen 218 kDa protein, Chromodomain helicase-DNA-binding protein 4, CHD4, Mi2-beta, CHD-4, ATP-dependent helicase CHD4, DKFZp686E06161, chromodomain helicase DNA binding protein 4, Mi2-BETA

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:105.50

小脳:50.40

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:296.70

末梢神経:61.30

脊柱:224.60

網膜:-

目:235.10

動脈:209.80

静脈:-

リンパ節:182

末梢血:72.90

脾臓:-

胸腺:167.50

骨髄:98.40

脂肪:121

骨:127.90

皮膚:144

GeneChip

大脳:7.93

小脳:7.37

脳幹:7.95

脳梁:8.11

松果体:-

末梢神経:8.15

脊柱:7.91

網膜:-

目:-

動脈:8.38

静脈:7.88

リンパ節:8.42

末梢血:-

脾臓:8.42

胸腺:8.93

骨髄:7.64

脂肪:7.94

骨:-

皮膚:8.10

CAGE

大脳:4.03

小脳:-

脳幹:4.12

脳梁:4.33

松果体:4.60

末梢神経:-

脊柱:4.56

網膜:-

目:-

動脈:4.38

静脈:4.69

リンパ節:4.24

末梢血:-

脾臓:4.30

胸腺:5.04

骨髄:-

脂肪:3.90

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.39

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.65

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.95

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:127.60

胎盤:98.40

前立腺:33.80

卵巣:186.30

精巣:147.10

心臓:102.20

骨格筋:40.20

食道:342.80

胃:191.20

腸:97.20

結腸:229

肝臓:105.60

肺:180.80

膀胱:-

腎臓:104

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:152.40

膵臓:124.50

乳腺:297.40

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.35

胎盤:7.20

前立腺:8.11

卵巣:8.31

精巣:8.31

心臓:7.82

骨格筋:7.36

食道:8.37

胃:8.26

腸:7.58

結腸:7.98

肝臓:8.06

肺:7.93

膀胱:-

腎臓:8.19

下垂体:8.24

甲状腺:8.58

副腎:8.49

膵臓:7.41

乳腺:8.36

唾液腺:7.41

CAGE

子宮:4.26

胎盤:4.10

前立腺:4.07

卵巣:4.47

精巣:4.43

心臓:4.67

骨格筋:4.41

食道:4.31

胃:-

腸:3.78

結腸:4.33

肝臓:3.97

肺:4.32

膀胱:4.50

腎臓:4.12

下垂体:3.93

甲状腺:4.12

副腎:-

膵臓:4.07

乳腺:4.23

唾液腺:3.49

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.04

卵巣:5.74

精巣:5.00

心臓:4.40

骨格筋:4.93

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.50

肝臓:3.74

肺:4.77

膀胱:-

腎臓:4.69

下垂体:-

甲状腺:5.69

副腎:4.64

膵臓:-

乳腺:4.20

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001273
Gene ID	1108
Unigene ID	Hs.162233
Probe set ID	201183_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000111642
GTEx ID	ENSG00000111642

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_145979
ラット[3]	NM_145979

染色体

12p13.31 [6,679,249 - 6,716,642]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953	Chromo domain
IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR019787	Zinc finger, PHD-finger
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005813	centrosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0016581	NuRD complex

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0004003	ATP-dependent DNA helicase activity
GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008270	zinc ion binding

chromodomain helicase DNA binding protein 4

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function