protein tyrosine phosphatase, receptor type, T

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同義遺伝子名

RPTPrho, RPTP-rho, protein tyrosine phosphatase, receptor type, T, KIAA0283, R-PTP-T, PTPRT

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:52.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:237.30 目:41.10 動脈:- 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:38.70 骨髄:19.70 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:6.62 小脳:5.74 脳幹:6.12 脳梁:5.52 松果体:- 末梢神経:5.71 脊柱:5.84 網膜:- 目:- 動脈:5.63 静脈:5.50 リンパ節:5.47 末梢血:- 脾臓:5.14 胸腺:5.70 骨髄:5.66 脂肪:5.71 骨:- 皮膚:5.49
CAGE 大脳:2.60 小脳:- 脳幹:1.49 脳梁:1.49 松果体:0.21 末梢神経:- 脊柱:1.42 網膜:- 目:- 動脈:0.59 静脈:1.73 リンパ節:1.06 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:2.38 骨髄:- 脂肪:0.63 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.53 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:7.30 前立腺:- 卵巣:149.10 精巣:30.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:17     肝臓:10.60        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:347.90 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:130.10 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.12 胎盤:5.59 前立腺:5.19 卵巣:5.85 精巣:5.31 心臓:5.77 骨格筋:5.66 食道:5.28 胃:5.56 腸:5.81 結腸:5.93 肝臓:5.67 肺:5.50 膀胱:- 腎臓:5.72 下垂体:6.06 甲状腺:5.37 副腎:5.78 膵臓:5.76 乳腺:5.59 唾液腺:5.85
CAGE 子宮:0.35 胎盤:1.35 前立腺:0.53 卵巣:0.37 精巣:1.01 心臓:0.20 骨格筋:0 食道:0.09 胃:- 腸:0.77 結腸:0.71     肝臓:0.63    肺:0.10 膀胱:0.09 腎臓:0 下垂体:1.70 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0.90 唾液腺:1.39
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0.00 心臓:0.00 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_133170
Gene ID 11122
Unigene ID Hs.526879
Probe set ID 205948_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000196090
GTEx ID ENSG00000196090

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_021464
ラット[4]  NM_021464

染色体

20q13.11  [40,701,392  -  41,818,610]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003961  Fibronectin, type III
IPR008957  Fibronectin, type III-like fold
IPR000242  Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889549
9179496
9486824
9602027
11423001
11780052
11814386
12477932
15155950
16273344
16344560
16973135
17223850
17360477
18519826
18644975
18668548
19351817
19816407
20133777
20201926
20379614
21145461
21517784
22389709
23382691
24024966
24395800
24434140

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation
GO:0007165  signal transduction
GO:0007169  transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway

Cellular Component

GO:0009986  cell surface
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0051393  alpha-actinin binding
GO:0045294  alpha-catenin binding
GO:0008013  beta-catenin binding
GO:0045296  cadherin binding
GO:0070097  delta-catenin binding
GO:0045295  gamma-catenin binding
GO:0005515  protein binding
GO:0004725  protein tyrosine phosphatase activity
GO:0016790  thiolester hydrolase activity