trinucleotide repeat containing 4

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同義遺伝子名

MGC57297, ERDA4, CAGH4, BRUNOL1, TNRC4, CELF3, trinucleotide repeat containing 4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:2.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:23.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:6.80 小脳:6.90 脳幹:6.79 脳梁:6.77 松果体:- 末梢神経:6.22 脊柱:6.46 網膜:- 目:- 動脈:6.39 静脈:6.60 リンパ節:6.28 末梢血:- 脾臓:6.17 胸腺:6.35 骨髄:6.63 脂肪:6.45 骨:- 皮膚:6.07
CAGE 大脳:3.85 小脳:- 脳幹:1.73 脳梁:2.38 松果体:5.67 末梢神経:- 脊柱:1.59 網膜:- 目:- 動脈:0.34 静脈:0 リンパ節:0.03 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.66 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.08 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.26 胎盤:6.23 前立腺:6.07 卵巣:6.39 精巣:6.06 心臓:6.62 骨格筋:6.85 食道:6.46 胃:6.47 腸:6.45 結腸:6.65 肝臓:6.60 肺:6.16 膀胱:- 腎臓:6.66 下垂体:7.13 甲状腺:6.19 副腎:6.66 膵臓:6.97 乳腺:6.17 唾液腺:6.55
CAGE 子宮:0.09 胎盤:0 前立腺:0.27 卵巣:0.14 精巣:0.56 心臓:0 骨格筋:0 食道:0 胃:- 腸:1.39 結腸:1.28     肝臓:0    肺:0.10 膀胱:0.26 腎臓:0 下垂体:4.54 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.01 精巣:0.00 心臓:0.00 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.25     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_007185
Gene ID 11189
Unigene ID Hs.623956
Probe set ID 206817_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000159409
GTEx ID ENSG00000159409

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_172434
ラット[1]  NM_172434

染色体

1q21.3  [151,674,880  -  151,689,290]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002343  Paraneoplastic encephalomyelitis antigen
IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9225980
10893231
11158314
12477932
14702039
15009664
16169070
16713569
17725984
19913121
20628086
21900206

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0048026  positive regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000381  regulation of alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380  RNA splicing
GO:0030317  sperm motility
GO:0007283  spermatogenesis

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003729  mRNA binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0003723  RNA binding