choroideremia (Rab escort protein 1)

同義遺伝子名

FLJ38564, REP1, DXS540, choroideremia (Rab escort protein 1), Choroideraemia protein, TCD, REP-1, Rab escort protein 1, MGC102710, GGTA, CHM, TCD protein, HSD-32

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:56.90

小脳:75.60

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:29.40

動脈:149.90

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:18.20

脾臓:75.60

胸腺:51.50

骨髄:-

脂肪:-

骨:64

皮膚:33.60

GeneChip

大脳:3.67

小脳:3.63

脳幹:3.51

脳梁:3.37

松果体:-

末梢神経:3.27

脊柱:3.40

網膜:-

目:-

動脈:3.27

静脈:3.38

リンパ節:3.10

末梢血:-

脾臓:3.16

胸腺:3.73

骨髄:3.29

脂肪:3.33

骨:-

皮膚:3.31

CAGE

大脳:3.74

小脳:-

脳幹:3.65

脳梁:3.32

松果体:4.00

末梢神経:-

脊柱:3.75

網膜:-

目:-

動脈:2.83

静脈:3.26

リンパ節:3.15

末梢血:-

脾臓:3.43

胸腺:3.54

骨髄:-

脂肪:3.58

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.04

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.04

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.07

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:21.90

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:64.80

結腸:8.50

肝臓:10.60

肺:68.40

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:26.70

乳腺:111.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.27

胎盤:3.44

前立腺:3.24

卵巣:3.55

精巣:3.04

心臓:3.37

骨格筋:3.37

食道:3.19

胃:3.30

腸:3.35

結腸:3.21

肝臓:3.33

肺:3.31

膀胱:-

腎臓:3.29

下垂体:3.43

甲状腺:3.12

副腎:3.16

膵臓:3.71

乳腺:3.06

唾液腺:3.21

CAGE

子宮:3.73

胎盤:3.35

前立腺:3.32

卵巣:3.36

精巣:2.83

心臓:3.07

骨格筋:3.10

食道:3.24

胃:-

腸:2.96

結腸:2.87

肝臓:3.20

肺:3.29

膀胱:3.53

腎臓:3.65

下垂体:4.56

甲状腺:3.21

副腎:-

膵臓:2.54

乳腺:2.64

唾液腺:2.75

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.68

卵巣:2.28

精巣:2.08

心臓:2.05

骨格筋:1.96

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.02

肝臓:1.73

肺:2.22

膀胱:-

腎臓:2.87

下垂体:-

甲状腺:2.94

副腎:2.14

膵臓:-

乳腺:2.31

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000390
Gene ID	1121
Unigene ID	Hs.496449
Probe set ID	207099_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000188419
GTEx ID	ENSG00000188419

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_018818
ラット [0]

染色体

Xq21.2 [85,116,185 - 85,302,566]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR018203	GDP dissociation inhibitor
IPR001738	Rab escort (choroideraemia) protein
IPR016664	Rab protein geranylgeranyltransferase component A, eukaryota

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0001568	blood vessel development
GO:0006886	intracellular protein transport
GO:0018344	protein geranylgeranylation
GO:0050896	response to stimulus
GO:0007601	visual perception

Cellular Component

GO:0005968

Rab-protein geranylgeranyltransferase complex

Molecular Function

GO:0005096	GTPase activator activity
GO:0004663	Rab geranylgeranyltransferase activity

choroideremia (Rab escort protein 1)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function