three prime repair exonuclease 1

同義遺伝子名

ATRIP, DKFZp434J0310, DNase III, Three prime repair exonuclease 1, DRN3, three prime repair exonuclease 1, FLJ12343, 3'-5' exonuclease TREX1, Aicardi-Goutieres syndrome 1, AGS1, TREX1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:6.53

小脳:6.50

脳幹:6.60

脳梁:6.67

松果体:-

末梢神経:6.60

脊柱:6.51

網膜:-

目:-

動脈:6.76

静脈:6.64

リンパ節:7.15

末梢血:-

脾臓:7.16

胸腺:6.68

骨髄:6.72

脂肪:6.87

骨:-

皮膚:7.44

CAGE

大脳:2.84

小脳:-

脳幹:2.54

脳梁:2.95

松果体:2.06

末梢神経:-

脊柱:2.36

網膜:-

目:-

動脈:3.11

静脈:3.37

リンパ節:3.48

末梢血:-

脾臓:3.56

胸腺:3.09

骨髄:-

脂肪:3.05

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.61

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.36

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:6.57

胎盤:6.57

前立腺:7.30

卵巣:6.52

精巣:6.24

心臓:6.33

骨格筋:6.36

食道:7.25

胃:6.44

腸:6.57

結腸:6.89

肝臓:6.48

肺:6.89

膀胱:-

腎臓:6.54

下垂体:7.16

甲状腺:6.57

副腎:6.58

膵臓:6.64

乳腺:6.94

唾液腺:7.06

CAGE

子宮:2.58

胎盤:2.73

前立腺:2.94

卵巣:2.33

精巣:2.11

心臓:2.66

骨格筋:2.54

食道:3.15

胃:-

腸:2.67

結腸:2.62

肝臓:2.74

肺:3.16

膀胱:2.68

腎臓:2.77

下垂体:3.92

甲状腺:1.83

副腎:-

膵臓:2.60

乳腺:3.22

唾液腺:3.74

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.54

卵巣:1.26

精巣:1.58

心臓:0.71

骨格筋:2.46

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.22

肝臓:1.09

肺:3.45

膀胱:-

腎臓:1.39

下垂体:-

甲状腺:2.44

副腎:3.13

膵臓:-

乳腺:2.62

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_033629
Gene ID	11277
Unigene ID	-
Probe set ID	205875_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000213689
GTEx ID	ENSG00000213689

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001012236, NM_011637
ラット[1]	NM_001024989, NM_011637

染色体

3p21.31 [48,506,445 - 48,509,044]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006055	Exonuclease
IPR013520	Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III
IPR012337	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H fold

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008219	cell death
GO:0006259	DNA metabolic process
GO:0006310	DNA recombination
GO:0006281	DNA repair
GO:0006260	DNA replication
GO:0045087	innate immune response
GO:0006298	mismatch repair
GO:0032481	positive regulation of type I interferon production
GO:0032479	regulation of type I interferon production

Cellular Component

GO:0005789	endoplasmic reticulum membrane
GO:0005635	nuclear envelope

Molecular Function

GO:0008408	3'-5' exonuclease activity
GO:0008296	3'-5'-exodeoxyribonuclease activity
GO:0032558	adenyl deoxyribonucleotide binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0008853	exodeoxyribonuclease III activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0032405	MutLalpha complex binding
GO:0032407	MutSalpha complex binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0003697	single-stranded DNA binding

three prime repair exonuclease 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function