FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4

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同義遺伝子名

frabin, FGD1-related F-actin-binding protein, DKFZp313E1818, FRABP, FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, ZFYVE6, MGC57222, FRABIN, Actin filament-binding protein frabin, Zinc finger FYVE domain-containing protein 6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:51 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:296.70 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:52.90 動脈:- 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:18.20 脾臓:56.70 胸腺:12.90 骨髄:275.50 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:38.40
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.56 小脳:- 脳幹:4.05 脳梁:4.00 松果体:4.51 末梢神経:- 脊柱:4.54 網膜:- 目:- 動脈:3.65 静脈:2.96 リンパ節:3.16 末梢血:- 脾臓:3.82 胸腺:1.71 骨髄:- 脂肪:4.77 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.53 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.04 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.86 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:18.20 前立腺:45.10 卵巣:37.30 精巣:151.40 心臓:38.30 骨格筋:20.10 食道:- 胃:106.20 腸:64.80 結腸:101.80     肝臓:52.80        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:88.90 乳腺:46.50 唾液腺:328.40
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.39 胎盤:3.95 前立腺:3.46 卵巣:4.10 精巣:4.07 心臓:3.47 骨格筋:4.18 食道:3.74 胃:- 腸:4.65 結腸:4.15     肝臓:3.72    肺:4.32 膀胱:3.59 腎臓:4.06 下垂体:3.41 甲状腺:3.35 副腎:- 膵臓:3.63 乳腺:3.87 唾液腺:3.40
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.83 卵巣:2.32 精巣:3.07 心臓:2.61 骨格筋:2.51 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.30     肝臓:1.78        肺:2.21    膀胱:- 腎臓:3.13 下垂体:- 甲状腺:2.56 副腎:1.84 膵臓:- 乳腺:2.64 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_139241
Gene ID 121512
Unigene ID Hs.117835
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000139132
GTEx ID ENSG00000139132

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_139232, NM_139233, NM_139234
ラット[1]  NM_139263, NM_139233, NM_139234

染色体

12p11.21  [32,552,463  -  32,798,984]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001849  Pleckstrin homology
IPR000306  Zinc finger, FYVE-type
IPR011011  Zinc finger, FYVE/PHD-type
IPR013083  Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9668039
11429692
11527409
11756498
12376548
12477932
12787561
14702039
15133042
15744041
17564959
17564972
18029348
19221294
19332693
19494521
20301532
20301641
20379614
22295116
22589722
22734899
22843789
23926620

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030036  actin cytoskeleton organization
GO:0007010  cytoskeleton organization
GO:0046847  filopodium assembly
GO:0030032  lamellipodium assembly
GO:0030035  microspike assembly
GO:0048011  nerve growth factor receptor signaling pathway
GO:0043065  positive regulation of apoptosis
GO:0043088  regulation of Cdc42 GTPase activity
GO:0008360  regulation of cell shape
GO:0051056  regulation of small GTPase mediated signal transduction
GO:0007264  small GTPase mediated signal transduction

Cellular Component

GO:0015629  actin cytoskeleton
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0030175  filopodium
GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0030027  lamellipodium
GO:0001726  ruffle

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0005085  guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0005543  phospholipid binding
GO:0005089  Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0031267  small GTPase binding