calponin 1, basic, smooth muscle

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同義遺伝子名

Sm-Calp, calponin 1, basic, smooth muscle, Calponin H1, smooth muscle, CNN1, Basic calponin, SMCC, Calponin-1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:15.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:112.30 網膜:118.60 目:11.80 動脈:30 静脈:533.20 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:37.80 胸腺:- 骨髄:19.70 脂肪:201.70 骨:- 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:5.28 小脳:5.04 脳幹:5.60 脳梁:4.77 松果体:- 末梢神経:6.29 脊柱:5.27 網膜:- 目:- 動脈:11.12 静脈:12.37 リンパ節:6.26 末梢血:- 脾臓:5.46 胸腺:4.80 骨髄:5.02 脂肪:7.68 骨:- 皮膚:7.85
CAGE 大脳:1.09 小脳:- 脳幹:1.61 脳梁:2.31 松果体:1.86 末梢神経:- 脊柱:1.65 網膜:- 目:- 動脈:7.11 静脈:5.64 リンパ節:3.06 末梢血:- 脾臓:2.01 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:4.11 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.96 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.37 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.66 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:373.60 胎盤:36.40 前立腺:169 卵巣:74.50 精巣:86.50 心臓:38.30 骨格筋:20.10 食道:1028.50 胃:594.80 腸:356.40 結腸:407     肝臓:-        肺:24.40    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:- 乳腺:65.10 唾液腺:656.80
GeneChip 子宮:10.64 胎盤:6.85 前立腺:10.98 卵巣:8.89 精巣:8.50 心臓:8.15 骨格筋:6.01 食道:7.59 胃:10.27 腸:10.06 結腸:10.63 肝臓:5.23 肺:6.80 膀胱:- 腎臓:6.11 下垂体:5.16 甲状腺:6.07 副腎:6.36 膵臓:5.46 乳腺:9.24 唾液腺:7.81
CAGE 子宮:7.16 胎盤:3.43 前立腺:7.05 卵巣:5.78 精巣:4.64 心臓:4.71 骨格筋:3.51 食道:7.15 胃:- 腸:5.61 結腸:6.98     肝臓:1.81    肺:4.17 膀胱:8.10 腎臓:3.98 下垂体:1.00 甲状腺:3.22 副腎:- 膵臓:1.87 乳腺:4.20 唾液腺:4.57
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:9.61 卵巣:5.79 精巣:7.17 心臓:4.85 骨格筋:3.68 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.97     肝臓:0.65        肺:6.77    膀胱:- 腎臓:3.81 下垂体:- 甲状腺:3.95 副腎:7.18 膵臓:- 乳腺:5.10 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001299
Gene ID 1264
Unigene ID Hs.465929
Probe set ID 203951_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000130176
GTEx ID ENSG00000130176

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_009922
ラット[1]  NM_009922

染色体

19p13.2  [11,649,579  -  11,661,138]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001997  Calponin
IPR016146  Calponin-homology
IPR001715  Calponin-like actin-binding
IPR003096  SM22/calponin

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2161834
2455687
8125298
8526917
8616889
8864837
9001224
9049805
9312127
9332369
9645345
10220577
11920541
12033495
12477932
12480535
12606518
14550641
15206927
15489334
17207965
17550897
17556051
17707120
19391217
19913121
20530411
20584679
20628086
21051832
21139048
21326813
21817093
23382691
23731614
24561123

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0031032  actomyosin structure organization
GO:0006940  regulation of smooth muscle contraction

Cellular Component

GO:0005856  cytoskeleton

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0005516  calmodulin binding