calponin 3, acidic

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同義遺伝子名

Calponin, acidic isoform, CNN3, calponin 3, acidic, Calponin-3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:7.08 小脳:7.04 脳幹:7.20 脳梁:7.99 松果体:- 末梢神経:8.79 脊柱:8.66 網膜:- 目:- 動脈:7.57 静脈:8.74 リンパ節:6.79 末梢血:- 脾臓:7.03 胸腺:6.20 骨髄:4.55 脂肪:8.09 骨:- 皮膚:6.88
CAGE 大脳:5.55 小脳:- 脳幹:5.32 脳梁:5.46 松果体:5.02 末梢神経:- 脊柱:6.60 網膜:- 目:- 動脈:5.98 静脈:5.50 リンパ節:5.11 末梢血:- 脾臓:5.00 胸腺:4.12 骨髄:- 脂肪:5.82 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:6.84 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:7.28 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:7.04 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:8.77 胎盤:8.17 前立腺:7.79 卵巣:8.76 精巣:6.70 心臓:7.84 骨格筋:5.37 食道:7.79 胃:7.11 腸:7.99 結腸:7.73 肝臓:7.01 肺:7.99 膀胱:- 腎臓:8.10 下垂体:6.74 甲状腺:7.31 副腎:8.18 膵臓:7.23 乳腺:7.81 唾液腺:6.46
CAGE 子宮:5.98 胎盤:5.45 前立腺:5.68 卵巣:6.12 精巣:5.00 心臓:5.89 骨格筋:4.41 食道:5.74 胃:- 腸:5.24 結腸:5.48     肝臓:5.67    肺:6.17 膀胱:5.89 腎臓:6.26 下垂体:5.40 甲状腺:5.72 副腎:- 膵臓:5.13 乳腺:6.47 唾液腺:4.46
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:6.84 卵巣:7.81 精巣:6.93 心臓:4.88 骨格筋:3.86 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:7.49     肝臓:6.06        肺:8.93    膀胱:- 腎臓:7.67 下垂体:- 甲状腺:6.54 副腎:7.23 膵臓:- 乳腺:6.78 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001839
Gene ID 1266
Unigene ID -
Probe set ID 201445_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000117519
GTEx ID ENSG00000117519

オーソログ対応遺伝子

マウス[5]  NM_028044
ラット[5]  NM_028044

染色体

1p21.3  [95,362,507  -  95,392,834]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001997  Calponin
IPR016146  Calponin-homology
IPR001715  Calponin-like actin-binding
IPR003096  SM22/calponin

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8526917
8889548
10457177
11591653
12033495
12477932
15146197
15206927
15489334
16344560
16710414
17081983
17620012
17825283
18927281
20379614
20861310
21103663
21139048
21890473
21906983
22119193
23000965
23362303
23398456
23545751

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0031032  actomyosin structure organization
GO:0006939  smooth muscle contraction

Cellular Component

GO:0005575  cellular_component

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0005516  calmodulin binding
GO:0005523  tropomyosin binding
GO:0030172  troponin C binding