collagen, type II, alpha 1

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同義遺伝子名

SEDC, Collagen alpha-1(II) chain precursor, COL2A1, COL11A3, AOM, MGC131516

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:5.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:2729.80

脊柱:-

網膜:-

目:29.40

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:1561

皮膚:14.40

GeneChip

大脳:3.28

小脳:3.38

脳幹:3.19

脳梁:3.28

松果体:-

末梢神経:3.39

脊柱:3.48

網膜:-

目:-

動脈:3.39

静脈:3.42

リンパ節:3.16

末梢血:-

脾臓:3.18

胸腺:3.12

骨髄:3.75

脂肪:3.28

骨:-

皮膚:3.46

CAGE

大脳:0.02

小脳:-

脳幹:0.12

脳梁:0.07

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0.09

網膜:-

目:-

動脈:3.04

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0.12

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.01

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:25.50

前立腺:-

卵巣:37.30

精巣:21.60

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:19.60

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:92.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.29

胎盤:3.59

前立腺:3.21

卵巣:3.19

精巣:3.70

心臓:3.25

骨格筋:3.61

食道:3.22

胃:3.85

腸:3.34

結腸:3.26

肝臓:3.30

肺:3.06

膀胱:-

腎臓:3.12

下垂体:4.71

甲状腺:3.10

副腎:3.28

膵臓:3.29

乳腺:3.62

唾液腺:3.14

CAGE

子宮:0

胎盤:0.08

前立腺:0.44

卵巣:0.07

精巣:0.12

心臓:0

骨格筋:0

食道:0

胃:-

腸:0

結腸:0.39

肝臓:0

肺:0.17

膀胱:0

腎臓:0

下垂体:0.95

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.14

卵巣:0.30

精巣:0.17

心臓:0

骨格筋:0.01

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.01

肝臓:0

肺:0.31

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:0.01

膵臓:-

乳腺:0.24

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_033150
Gene ID	1280
Unigene ID	Hs.408182
Probe set ID	213492_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000139219
GTEx ID	ENSG00000139219

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001113515, NM_031163
ラット [0]

染色体

12q13.11 [48,366,748 - 48,398,269]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007411	axon guidance
GO:0001502	cartilage condensation
GO:0051216	cartilage development
GO:0060351	cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis
GO:0007417	central nervous system development
GO:0002062	chondrocyte differentiation
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0030199	collagen fibril organization
GO:0060272	embryonic skeletal joint morphogenesis
GO:0001958	endochondral ossification
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0003007	heart morphogenesis
GO:0042472	inner ear morphogenesis
GO:0060174	limb bud formation
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0030903	notochord development
GO:0060021	palate development
GO:0006029	proteoglycan metabolic process
GO:0010468	regulation of gene expression
GO:0007605	sensory perception of sound
GO:0001501	skeletal system development
GO:0001894	tissue homeostasis
GO:0007601	visual perception

Cellular Component

GO:0005604	basement membrane
GO:0005585	collagen type II
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space

Molecular Function

GO:0030020	extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength
GO:0042802	identical protein binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0048407	platelet-derived growth factor binding

collagen, type II, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function