collagen, type IV, alpha 1

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同義遺伝子名

collagen, type IV, alpha 1, COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain precursor, arresten

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:22.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:828.10

脊柱:449.20

網膜:118.60

目:146.90

動脈:269.80

静脈:199.90

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:208

胸腺:-

骨髄:177.10

脂肪:443.70

骨:38.40

皮膚:76.80

GeneChip

大脳:4.85

小脳:4.58

脳幹:4.98

脳梁:4.70

松果体:-

末梢神経:7.44

脊柱:5.17

網膜:-

目:-

動脈:8.71

静脈:8.44

リンパ節:6.18

末梢血:-

脾臓:8.18

胸腺:5.33

骨髄:5.20

脂肪:9.05

骨:-

皮膚:7.12

CAGE

大脳:2.57

小脳:-

脳幹:2.83

脳梁:2.50

松果体:3.38

末梢神経:-

脊柱:3.43

網膜:-

目:-

動脈:6.09

静脈:5.08

リンパ節:4.17

末梢血:-

脾臓:5.85

胸腺:2.86

骨髄:-

脂肪:6.26

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.88

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.34

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:7.04

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:373.60

胎盤:495.50

前立腺:101.40

卵巣:149.10

精巣:26

心臓:574.70

骨格筋:80.40

食道:-

胃:63.70

腸:97.20

結腸:118.70

肝臓:31.70

肺:176

膀胱:-

腎臓:135.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:151.10

乳腺:130.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.45

胎盤:10.46

前立腺:7.12

卵巣:7.39

精巣:5.33

心臓:8.36

骨格筋:6.13

食道:6.16

胃:7.87

腸:8.49

結腸:8.10

肝臓:5.81

肺:7.78

膀胱:-

腎臓:6.81

下垂体:5.30

甲状腺:7.01

副腎:7.04

膵臓:7.27

乳腺:7.25

唾液腺:5.78

CAGE

子宮:5.36

胎盤:6.69

前立腺:5.03

卵巣:4.78

精巣:3.73

心臓:5.43

骨格筋:5.00

食道:4.81

胃:-

腸:3.94

結腸:5.14

肝臓:3.41

肺:5.22

膀胱:5.63

腎臓:4.78

下垂体:3.05

甲状腺:4.51

副腎:-

膵臓:3.85

乳腺:6.00

唾液腺:3.58

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.62

卵巣:4.00

精巣:4.97

心臓:4.77

骨格筋:3.81

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:6.73

肝臓:2.42

肺:7.62

膀胱:-

腎臓:5.49

下垂体:-

甲状腺:4.24

副腎:5.59

膵臓:-

乳腺:6.86

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001845
Gene ID	1282
Unigene ID	Hs.17441
Probe set ID	211981_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000187498
GTEx ID	ENSG00000187498

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_009931
ラット[1]	NM_001135009

染色体

13q34 [110,801,311 - 110,959,496]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0001525	angiogenesis
GO:0007411	axon guidance
GO:0071230	cellular response to amino acid stimulus
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0007528	neuromuscular junction development

GO:0005587	collagen type IV
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region

GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0048407	platelet-derived growth factor binding
GO:0005515	protein binding

collagen, type IV, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function