collagen, type IV, alpha 4

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同義遺伝子名

COL4A4, collagen, type IV, alpha 4, Collagen alpha-4(IV) chain precursor, CA44

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:41.10

動脈:-

静脈:-

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:18.90

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:3.28

小脳:3.11

脳幹:3.21

脳梁:3.25

松果体:-

末梢神経:3.33

脊柱:3.33

網膜:-

目:-

動脈:3.94

静脈:3.41

リンパ節:4.01

末梢血:-

脾臓:3.71

胸腺:3.42

骨髄:3.33

脂肪:3.39

骨:-

皮膚:3.04

CAGE

大脳:1.12

小脳:-

脳幹:1.50

脳梁:1.13

松果体:3.57

末梢神経:-

脊柱:2.16

網膜:-

目:-

動脈:3.09

静脈:2.33

リンパ節:2.78

末梢血:-

脾臓:2.09

胸腺:1.08

骨髄:-

脂肪:0.46

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.01

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.07

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:3.60

前立腺:-

卵巣:37.30

精巣:4.30

心臓:-

骨格筋:40.20

食道:-

胃:106.20

腸:-

結腸:-

肝臓:10.60

肺:19.60

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.27

胎盤:3.23

前立腺:3.55

卵巣:3.13

精巣:3.27

心臓:4.01

骨格筋:3.79

食道:3.20

胃:3.47

腸:3.39

結腸:3.54

肝臓:3.48

肺:3.66

膀胱:-

腎臓:5.28

下垂体:4.57

甲状腺:4.43

副腎:5.11

膵臓:3.33

乳腺:3.11

唾液腺:3.21

CAGE

子宮:1.79

胎盤:1.14

前立腺:2.75

卵巣:1.85

精巣:1.76

心臓:3.46

骨格筋:2.37

食道:1.78

胃:-

腸:0.84

結腸:1.31

肝臓:1.29

肺:3.31

膀胱:2.19

腎臓:3.93

下垂体:3.03

甲状腺:3.01

副腎:-

膵臓:1.98

乳腺:0.90

唾液腺:1.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.00

卵巣:0.47

精巣:1.18

心臓:1.17

骨格筋:0.45

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.17

肝臓:0.39

肺:1.39

膀胱:-

腎臓:3.16

下垂体:-

甲状腺:1.74

副腎:1.15

膵臓:-

乳腺:0.22

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000092
Gene ID	1286
Unigene ID	Hs.591645
Probe set ID	214602_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000081052
GTEx ID	ENSG00000081052

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_007735
ラット [0]

染色体

2q36.3 [227,867,427 - 228,028,829]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007411	axon guidance
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0032836	glomerular basement membrane development

Cellular Component

GO:0005605	basal lamina
GO:0005587	collagen type IV
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region

Molecular Function

GO:0005201

extracellular matrix structural constituent

collagen, type IV, alpha 4

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function