collagen, type IV, alpha 6

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同義遺伝子名

Collagen alpha-6(IV) chain precursor, MGC88184, COL4A6, collagen, type IV, alpha 6

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:3.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:64.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:28.80

GeneChip

大脳:3.77

小脳:3.91

脳幹:3.66

脳梁:4.14

松果体:-

末梢神経:3.86

脊柱:4.20

網膜:-

目:-

動脈:4.76

静脈:5.71

リンパ節:3.79

末梢血:-

脾臓:4.30

胸腺:4.17

骨髄:3.95

脂肪:4.23

骨:-

皮膚:5.13

CAGE

大脳:0.42

小脳:-

脳幹:0.90

脳梁:1.15

松果体:0.65

末梢神経:-

脊柱:1.23

網膜:-

目:-

動脈:2.30

静脈:1.10

リンパ節:0.28

末梢血:-

脾臓:0.09

胸腺:0.23

骨髄:-

脂肪:0.63

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.08

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:3.60

前立腺:101.40

卵巣:-

精巣:-

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:10.60

肺:14.70

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.75

胎盤:4.74

前立腺:6.78

卵巣:5.83

精巣:4.05

心臓:5.19

骨格筋:4.10

食道:5.08

胃:6.41

腸:4.64

結腸:4.81

肝臓:3.72

肺:4.32

膀胱:-

腎臓:5.07

下垂体:5.81

甲状腺:3.89

副腎:3.77

膵臓:3.85

乳腺:5.32

唾液腺:4.20

CAGE

子宮:3.48

胎盤:1.14

前立腺:3.44

卵巣:2.27

精巣:1.64

心臓:1.80

骨格筋:0.42

食道:3.79

胃:-

腸:1.35

結腸:0.89

肝臓:0.14

肺:1.20

膀胱:3.78

腎臓:1.75

下垂体:2.91

甲状腺:0.28

副腎:-

膵臓:0

乳腺:1.36

唾液腺:1.28

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.62

卵巣:0.79

精巣:0.98

心臓:0.19

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.58

下垂体:-

甲状腺:0.19

副腎:0.45

膵臓:-

乳腺:0.08

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_033641
Gene ID	1288
Unigene ID	Hs.145586
Probe set ID	213992_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000197565
GTEx ID	ENSG00000197565

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_053185
ラット[2]	NM_053185

染色体

Xq22.3 [107,386,780 - 107,682,727]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007155	cell adhesion
GO:0071230	cellular response to amino acid stimulus
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization

Cellular Component

GO:0005587	collagen type IV
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region

Molecular Function

GO:0005201

extracellular matrix structural constituent

collagen, type IV, alpha 6

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function