collagen, type VI, alpha 2

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同義遺伝子名

PP3610, DKFZp586E1322, Collagen alpha-2(VI) chain precursor, COL6A2, collagen, type VI, alpha 2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:52.10

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:552.10

脊柱:786.10

網膜:-

目:399.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:10.10

末梢血:-

脾臓:208

胸腺:38.70

骨髄:196.80

脂肪:443.70

骨:1241.10

皮膚:153.60

GeneChip

大脳:5.34

小脳:5.79

脳幹:5.44

脳梁:5.44

松果体:-

末梢神経:6.67

脊柱:5.33

網膜:-

目:-

動脈:8.22

静脈:7.99

リンパ節:6.37

末梢血:-

脾臓:5.93

胸腺:5.74

骨髄:5.47

脂肪:7.51

骨:-

皮膚:6.88

CAGE

大脳:2.34

小脳:-

脳幹:2.53

脳梁:3.20

松果体:3.68

末梢神経:-

脊柱:3.23

網膜:-

目:-

動脈:7.30

静脈:6.21

リンパ節:4.92

末梢血:-

脾臓:4.83

胸腺:3.78

骨髄:-

脂肪:6.15

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.07

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.66

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.06

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:501.20

胎盤:484.50

前立腺:687.10

卵巣:298.10

精巣:168.70

心臓:740.80

骨格筋:40.20

食道:-

胃:212.40

腸:97.20

結腸:84.80

肝臓:84.40

肺:283.50

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:142.30

乳腺:167.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.42

胎盤:6.79

前立腺:6.34

卵巣:7.27

精巣:5.80

心臓:7.14

骨格筋:6.13

食道:6.68

胃:6.87

腸:6.80

結腸:6.85

肝臓:6.07

肺:7.47

膀胱:-

腎臓:5.89

下垂体:5.55

甲状腺:6.57

副腎:6.46

膵臓:6.33

乳腺:7.37

唾液腺:6.43

CAGE

子宮:6.52

胎盤:5.41

前立腺:6.15

卵巣:5.92

精巣:5.31

心臓:6.25

骨格筋:5.07

食道:5.74

胃:-

腸:4.84

結腸:6.14

肝臓:3.67

肺:5.44

膀胱:6.40

腎臓:3.80

下垂体:3.85

甲状腺:4.44

副腎:-

膵臓:4.31

乳腺:6.47

唾液腺:4.65

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.53

卵巣:2.08

精巣:0.65

心臓:0.37

骨格筋:0.60

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.74

肝臓:0.23

肺:1.39

膀胱:-

腎臓:0.25

下垂体:-

甲状腺:0.35

副腎:0.69

膵臓:-

乳腺:1.38

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_058175
Gene ID	1292
Unigene ID	Hs.420269
Probe set ID	213290_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000142173
GTEx ID	ENSG00000142173

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_146007
ラット [0]

染色体

21q22.3 [47,518,011 - 47,552,763]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0007411	axon guidance
GO:0016337	cell-cell adhesion
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0070208	protein heterotrimerization

GO:0005581	collagen
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space
GO:0043234	protein complex
GO:0005578	proteinaceous extracellular matrix
GO:0042383	sarcolemma

GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0005515	protein binding
GO:0030674	protein binding, bridging

collagen, type VI, alpha 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function