collagen, type IX, alpha 2

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同義遺伝子名

DJ39G22.4, Collagen alpha-2(IX) chain precursor, COL9A2, EDM2, collagen, type IX, alpha 2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:27.30

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:1104.20

脊柱:-

網膜:-

目:117.50

動脈:-

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:64

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:6.98

小脳:5.23

脳幹:7.45

脳梁:7.94

松果体:-

末梢神経:5.15

脊柱:7.36

網膜:-

目:-

動脈:5.87

静脈:4.63

リンパ節:5.57

末梢血:-

脾臓:5.12

胸腺:4.80

骨髄:5.74

脂肪:5.27

骨:-

皮膚:5.18

CAGE

大脳:2.54

小脳:-

脳幹:3.56

脳梁:4.03

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:2.77

網膜:-

目:-

動脈:2.65

静脈:1.29

リンパ節:1.36

末梢血:-

脾臓:0.45

胸腺:0.37

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.22

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.14

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.19

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:14.60

前立腺:56.30

卵巣:37.30

精巣:4.30

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:17

肝臓:-

肺:4.90

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.13

胎盤:5.17

前立腺:6.24

卵巣:4.91

精巣:4.91

心臓:5.03

骨格筋:5.39

食道:4.75

胃:6

腸:5.18

結腸:5.56

肝臓:5.29

肺:5.14

膀胱:-

腎臓:6.02

下垂体:8.06

甲状腺:5.58

副腎:5.20

膵臓:5.15

乳腺:5.53

唾液腺:5.70

CAGE

子宮:0.84

胎盤:0

前立腺:1.42

卵巣:0.14

精巣:0.56

心臓:0.71

骨格筋:0

食道:0.26

胃:-

腸:0.07

結腸:0.04

肝臓:0

肺:0.31

膀胱:0.78

腎臓:1.51

下垂体:2.47

甲状腺:1.45

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:1.16

唾液腺:1.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.48

卵巣:0.62

精巣:0.62

心臓:0.09

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.62

肝臓:0.15

肺:1.41

膀胱:-

腎臓:2.43

下垂体:-

甲状腺:2.05

副腎:1.44

膵臓:-

乳腺:1.04

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001852
Gene ID	1298
Unigene ID	Hs.418012
Probe set ID	213622_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000049089
GTEx ID	ENSG00000049089

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_007741
ラット[1]	NM_001108675

染色体

1p34.2 [40,766,159 - 40,783,488]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007411	axon guidance
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0001501	skeletal system development

Cellular Component

GO:0005594	collagen type IX
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region

Molecular Function

GO:0030020

extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength

collagen, type IX, alpha 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function