collagen, type X, alpha 1

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同義遺伝子名

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain precursor

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:17.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:38.40

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:5.26

小脳:5.01

脳幹:5.10

脳梁:5.01

松果体:-

末梢神経:5.01

脊柱:5.05

網膜:-

目:-

動脈:5.15

静脈:5.11

リンパ節:5.02

末梢血:-

脾臓:5.51

胸腺:4.76

骨髄:5.08

脂肪:5.07

骨:-

皮膚:5.06

CAGE

大脳:0.02

小脳:-

脳幹:0.03

脳梁:0.24

松果体:0.21

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:1.68

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0.80

胸腺:0.18

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.31

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.04

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.03

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.80

胎盤:4.92

前立腺:4.74

卵巣:5.05

精巣:4.73

心臓:5.06

骨格筋:5.50

食道:4.97

胃:4.97

腸:6.10

結腸:5.29

肝臓:5

肺:4.93

膀胱:-

腎臓:5.05

下垂体:5.19

甲状腺:5.15

副腎:5.20

膵臓:5.41

乳腺:5.15

唾液腺:5.47

CAGE

子宮:0.09

胎盤:0

前立腺:0

卵巣:0.47

精巣:0.13

心臓:0

骨格筋:0

食道:0.09

胃:-

腸:0

結腸:0

肝臓:0

肺:0.10

膀胱:0

腎臓:0.08

下垂体:0

甲状腺:0.06

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.16

卵巣:0.57

精巣:0.12

心臓:0.08

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0.06

肺:0.48

膀胱:-

腎臓:0.33

下垂体:-

甲状腺:0.06

副腎:0.11

膵臓:-

乳腺:0.05

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000493
Gene ID	1300
Unigene ID	Hs.520339
Probe set ID	205941_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000123500
GTEx ID	ENSG00000123500

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009925
ラット[1]	NM_009925

染色体

6q22.1 [116,440,086 - 116,479,910]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0001501	skeletal system development

Cellular Component

GO:0005938	cell cortex
GO:0005581	collagen
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region

Molecular Function

GO:0046872

metal ion binding

collagen, type X, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function