collagen, type XIII, alpha 1

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同義遺伝子名

collagen, type XIII, alpha 1, COL13A1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:3.13

小脳:6.17

脳幹:3.24

脳梁:3

松果体:-

末梢神経:3.20

脊柱:3.53

網膜:-

目:-

動脈:5.29

静脈:3.49

リンパ節:3.31

末梢血:-

脾臓:4.07

胸腺:3.10

骨髄:3.21

脂肪:3.18

骨:-

皮膚:3.58

CAGE

大脳:0.79

小脳:-

脳幹:0.65

脳梁:0.18

松果体:1.35

末梢神経:-

脊柱:0.94

網膜:-

目:-

動脈:2.51

静脈:0.88

リンパ節:0.35

末梢血:-

脾臓:1.06

胸腺:0.06

骨髄:-

脂肪:0.36

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:3.57

胎盤:3.12

前立腺:4.60

卵巣:3.20

精巣:3.13

心臓:3.54

骨格筋:3.09

食道:3.11

胃:4.27

腸:3.65

結腸:3.74

肝臓:3.05

肺:5.78

膀胱:-

腎臓:3.24

下垂体:3.57

甲状腺:3.12

副腎:3.62

膵臓:3.13

乳腺:3.42

唾液腺:2.85

CAGE

子宮:1.07

胎盤:0.37

前立腺:2.41

卵巣:0.60

精巣:0.45

心臓:1.09

骨格筋:0.82

食道:0.63

胃:-

腸:1.20

結腸:1.23

肝臓:0.14

肺:2.16

膀胱:1.06

腎臓:0.15

下垂体:0.19

甲状腺:0.23

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0.62

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.00

精巣:0.10

心臓:0.00

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0.00

肺:0.18

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:0.07

膵臓:-

乳腺:0.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_080800
Gene ID	1305
Unigene ID	-
Probe set ID	211343_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000197467
GTEx ID	ENSG00000197467

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_007731
ラット[1]	NM_001109172

染色体

10q22.1 [71,561,644 - 71,724,031]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0030154	cell differentiation
GO:0016337	cell-cell adhesion
GO:0007160	cell-matrix adhesion
GO:0030574	collagen catabolic process
GO:0001958	endochondral ossification
GO:0022617	extracellular matrix disassembly
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0001763	morphogenesis of a branching structure

GO:0005911	cell-cell junction
GO:0005600	collagen type XIII
GO:0005788	endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576	extracellular region
GO:0016021	integral to membrane
GO:0005886	plasma membrane

GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0008201	heparin binding
GO:0005515	protein binding

collagen, type XIII, alpha 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function