collagen, type XIII, alpha 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

collagen, type XIII, alpha 1, COL13A1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:5.41 小脳:6.38 脳幹:5.49 脳梁:5.36 松果体:- 末梢神経:5.22 脊柱:5.36 網膜:- 目:- 動脈:5.97 静脈:5.87 リンパ節:5.46 末梢血:- 脾臓:5.45 胸腺:5.35 骨髄:5.56 脂肪:5.66 骨:- 皮膚:5.89
CAGE 大脳:0.79 小脳:- 脳幹:0.65 脳梁:0.18 松果体:1.35 末梢神経:- 脊柱:0.94 網膜:- 目:- 動脈:2.51 静脈:0.88 リンパ節:0.35 末梢血:- 脾臓:1.06 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:0.36 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:5.58 胎盤:5.49 前立腺:5.70 卵巣:5.53 精巣:5.33 心臓:5.53 骨格筋:5.75 食道:5.45 胃:5.57 腸:5.75 結腸:5.78 肝臓:5.13 肺:6.21 膀胱:- 腎臓:5.17 下垂体:5.44 甲状腺:5.45 副腎:5.41 膵臓:6.01 乳腺:5.37 唾液腺:5.40
CAGE 子宮:1.07 胎盤:0.37 前立腺:2.41 卵巣:0.60 精巣:0.45 心臓:1.09 骨格筋:0.82 食道:0.63 胃:- 腸:1.20 結腸:1.23     肝臓:0.14    肺:2.16 膀胱:1.06 腎臓:0.15 下垂体:0.19 甲状腺:0.23 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0.62
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0.10 心臓:0.00 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.18    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.07 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_080800
Gene ID 1305
Unigene ID -
Probe set ID 211809_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000197467
GTEx ID ENSG00000197467

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_007731
ラット[1]  NM_001109172

染色体

10q22.1  [71,561,644  -  71,724,031]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1447209
1447210
1698771
1894651
2459707
2767682
3547403
8246446
9624150
10429945
10713152
10865988
11956183
12477932
12832406
15146197
16341674
16368877
16385451
19851296
20198315
20708005
23793441

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030154  cell differentiation
GO:0016337  cell-cell adhesion
GO:0007160  cell-matrix adhesion
GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0001958  endochondral ossification
GO:0022617  extracellular matrix disassembly
GO:0030198  extracellular matrix organization
GO:0001763  morphogenesis of a branching structure

Cellular Component

GO:0005911  cell-cell junction
GO:0005600  collagen type XIII
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576  extracellular region
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005201  extracellular matrix structural constituent
GO:0008201  heparin binding
GO:0005515  protein binding