collagen, type XIII, alpha 1

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

collagen, type XIII, alpha 1, COL13A1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.79 小脳:- 脳幹:0.65 脳梁:0.18 松果体:1.35 末梢神経:- 脊柱:0.94 網膜:- 目:- 動脈:2.51 静脈:0.88 リンパ節:0.35 末梢血:- 脾臓:1.06 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:0.36 骨:- 皮膚:-
RNA-seq nodata
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.07 胎盤:0.37 前立腺:2.41 卵巣:0.60 精巣:0.45 心臓:1.09 骨格筋:0.82 食道:0.63 胃:- 腸:1.20 結腸:1.23     肝臓:0.14    肺:2.16 膀胱:1.06 腎臓:0.15 下垂体:0.19 甲状腺:0.23 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0.62
RNA-seq nodata

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_080814
Gene ID 1305
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID -
GTEx ID -

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

10q22.1  [71,561,644  -  71,724,031]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1447209
1447210
1698771
1894651
2459707
2767682
3547403
8246446
9624150
10429945
10713152
10865988
11956183
12477932
12832406
15146197
16341674
16368877
16385451
19851296
20198315
20708005
23793441

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030154  cell differentiation
GO:0016337  cell-cell adhesion
GO:0007160  cell-matrix adhesion
GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0001958  endochondral ossification
GO:0022617  extracellular matrix disassembly
GO:0030198  extracellular matrix organization
GO:0001763  morphogenesis of a branching structure

Cellular Component

GO:0005911  cell-cell junction
GO:0005600  collagen type XIII
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576  extracellular region
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005201  extracellular matrix structural constituent
GO:0008201  heparin binding
GO:0005515  protein binding