collagen, type XIX, alpha 1

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同義遺伝子名

collagen, type XIX, alpha 1, D6S228E, COL9A1L, Collagen alpha-1(XIX) chain precursor, COL19A1, Collagen alpha-1(Y) chain

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:10.70 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:30 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:59 脂肪:- 骨:- 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:3.89 小脳:4.07 脳幹:3.94 脳梁:3.81 松果体:- 末梢神経:3.88 脊柱:3.87 網膜:- 目:- 動脈:4 静脈:4.05 リンパ節:3.99 末梢血:- 脾臓:3.76 胸腺:3.66 骨髄:4.24 脂肪:3.96 骨:- 皮膚:4.09
CAGE 大脳:1.99 小脳:- 脳幹:0.87 脳梁:0.24 松果体:0.51 末梢神経:- 脊柱:0.64 網膜:- 目:- 動脈:0.95 静脈:2.98 リンパ節:2.72 末梢血:- 脾臓:2.22 胸腺:1.47 骨髄:- 脂肪:2.43 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.33 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.23 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:37.30 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.86 胎盤:3.84 前立腺:3.69 卵巣:3.90 精巣:3.86 心臓:3.79 骨格筋:4.20 食道:3.92 胃:3.86 腸:3.84 結腸:4.12 肝臓:3.87 肺:3.94 膀胱:- 腎臓:3.82 下垂体:3.95 甲状腺:3.92 副腎:3.92 膵臓:3.97 乳腺:3.90 唾液腺:4
CAGE 子宮:0.13 胎盤:0.43 前立腺:2.60 卵巣:0 精巣:0.51 心臓:1.66 骨格筋:1.15 食道:1.11 胃:- 腸:0.48 結腸:1.33     肝臓:0    肺:0.35 膀胱:3.34 腎臓:1.34 下垂体:2.22 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0.55 唾液腺:0.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.30 卵巣:0.02 精巣:0.28 心臓:0.30 骨格筋:0.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.06     肝臓:0        肺:0.05    膀胱:- 腎臓:0.06 下垂体:- 甲状腺:0.08 副腎:0.58 膵臓:- 乳腺:0.01 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001858
Gene ID 1310
Unigene ID Hs.444842
Probe set ID 211011_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000082293
GTEx ID ENSG00000082293

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_007733
ラット[2]  NM_007733

染色体

6q13  [70,576,463  -  70,919,679]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1639419
7775380
7916703
8034603
8889548
9143499
9202028
9344653
12477932
12788917
14574404
15383545
15489334
18845531
20339536
20379614
21145461
23382691

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion
GO:0030154  cell differentiation
GO:0016337  cell-cell adhesion
GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0022617  extracellular matrix disassembly
GO:0030198  extracellular matrix organization
GO:0007519  skeletal muscle tissue development
GO:0001501  skeletal system development

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0005788  endoplasmic reticulum lumen
GO:0005576  extracellular region
GO:0005578  proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005201  extracellular matrix structural constituent
GO:0030674  protein binding, bridging