collagen, type VI, alpha 6

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同義遺伝子名

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発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:3.60 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:118.60 目:29.40 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:19.20
GeneChip nodata
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:0.05 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.09 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.26 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:3.60 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:44.50 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.15 卵巣:0.23 精巣:0.25 心臓:0.94 骨格筋:0.01 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.04        肺:3.07    膀胱:- 腎臓:0.07 下垂体:- 甲状腺:0.16 副腎:0.07 膵臓:- 乳腺:0.97 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001102608
Gene ID 131873
Unigene ID Hs.591282
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000206384
GTEx ID ENSG00000206384

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001102607, NM_172927
ラット[2]  NM_001102607, NM_172927

染色体

3q22.1  [130,279,178  -  130,395,888]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

16641997
18276594
18400749
20882040
21406227
22226732

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion
GO:0030574  collagen catabolic process
GO:0022617  extracellular matrix disassembly
GO:0030198  extracellular matrix organization

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0031012  extracellular matrix
GO:0005576  extracellular region