EGF-like, fibronectin type III and laminin G domains

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同義遺伝子名

AGRNL, AGRINL, EGFLAM, FLJ39155

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 大脳:0.55 小脳:- 脳幹:1.21 脳梁:1.01 松果体:3.02 末梢神経:- 脊柱:1.29 網膜:- 目:- 動脈:2.45 静脈:2.66 リンパ節:1.97 末梢血:- 脾臓:2.36 胸腺:1.75 骨髄:- 脂肪:3.11 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.73 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.34 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.51 胎盤:2.80 前立腺:2.60 卵巣:3.05 精巣:2.69 心臓:2.42 骨格筋:3.67 食道:2.16 胃:- 腸:1.07 結腸:1.72     肝臓:1.44    肺:0.86 膀胱:2.08 腎臓:1.85 下垂体:1.65 甲状腺:1.75 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:3.54 唾液腺:1.67
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.08 卵巣:2.18 精巣:0.71 心臓:1.73 骨格筋:1.69 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.38     肝臓:0.29        肺:0.56    膀胱:- 腎臓:0.04 下垂体:- 甲状腺:0.39 副腎:0.15 膵臓:- 乳腺:0.74 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_152403
Gene ID 133584
Unigene ID -
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000164318
GTEx ID ENSG00000164318

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_178748
ラット[1]  NM_001108938

染色体

5p13.2  [38,258,511  -  38,465,123]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008985  Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320  Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR001881  EGF-like calcium-binding
IPR000742  EGF-like, type 3
IPR003961  Fibronectin, type III
IPR008957  Fibronectin, type III-like fold
IPR001791  Laminin G

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
14702039
18641643
19727342
20078962
21129441
21145461
21890473
21963094
22760553
24163370

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030198  extracellular matrix organization
GO:0019800  peptide cross-linking via chondroitin 4-sulfate glycosaminoglycan
GO:0010811  positive regulation of cell-substrate adhesion

Cellular Component

GO:0005604  basement membrane
GO:0030054  cell junction
GO:0005614  interstitial matrix
GO:0045202  synapse

Molecular Function

GO:0005539  glycosaminoglycan binding