LSM11, U7 small nuclear RNA associated

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

LSM11, U7 small nuclear RNA associated, U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11, LSM11, FLJ38273

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:10.70 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:30 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.08 小脳:- 脳幹:1.52 脳梁:1.17 松果体:1.49 末梢神経:- 脊柱:1.61 網膜:- 目:- 動脈:1.43 静脈:1.39 リンパ節:1.51 末梢血:- 脾臓:1.26 胸腺:1.08 骨髄:- 脂肪:1.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.89 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.15 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.72 胎盤:1.02 前立腺:2.12 卵巣:1.48 精巣:2.34 心臓:1.04 骨格筋:0.82 食道:1.81 胃:- 腸:1.20 結腸:1.82     肝臓:0.55    肺:1.06 膀胱:2.68 腎臓:0.71 下垂体:1.62 甲状腺:1.00 副腎:- 膵臓:1.42 乳腺:2.11 唾液腺:1.00
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.74 卵巣:1.64 精巣:1.91 心臓:0.56 骨格筋:0.56 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.49     肝臓:0.31        肺:0.64    膀胱:- 腎臓:0.65 下垂体:- 甲状腺:0.73 副腎:1.13 膵臓:- 乳腺:0.58 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_173491
Gene ID 134353
Unigene ID Hs.631954
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000155858
GTEx ID ENSG00000155858

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_028185
ラット [0]  

染色体

5q33.3  [157,170,703  -  157,187,717]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001163  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain
IPR006649  Like-Sm ribonucleoprotein (LSM) domain, eukaryotic/archaea-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11574479
12477932
12975319
14702039
15489334
16087681
16714279
16914750
18029348
19322201
19928837
22939629
23071092
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0006398  histone mRNA 3'-end processing
GO:0008334  histone mRNA metabolic process
GO:0031124  mRNA 3'-end processing
GO:0000084  S phase of mitotic cell cycle
GO:0006369  termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0071204  histone pre-mRNA 3'end processing complex
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0005683  U7 snRNP

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0071209  U7 snRNA binding