shroom family member 1

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同義遺伝子名

SHROOM1, KIAA1960, APXL2, shroom family member 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:1.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:14.40
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.81 小脳:- 脳幹:3.61 脳梁:4.10 松果体:2.46 末梢神経:- 脊柱:3.32 網膜:- 目:- 動脈:2.02 静脈:1.39 リンパ節:1.10 末梢血:- 脾臓:0.61 胸腺:0.37 骨髄:- 脂肪:1.76 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.53 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.43 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:14.60 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:25.50 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:67.80     肝臓:10.60        肺:-    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:35.60 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.42 胎盤:2.16 前立腺:3.19 卵巣:1.54 精巣:1.18 心臓:1.95 骨格筋:1.04 食道:1.64 胃:- 腸:2.57 結腸:2.67     肝臓:3.58    肺:2.27 膀胱:2.41 腎臓:1.48 下垂体:1.60 甲状腺:1.83 副腎:- 膵臓:1.98 乳腺:2.19 唾液腺:2.22
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.31 卵巣:0.97 精巣:1.02 心臓:0.46 骨格筋:0.40 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.38     肝臓:2.91        肺:1.94    膀胱:- 腎臓:1.16 下垂体:- 甲状腺:0.61 副腎:0.72 膵臓:- 乳腺:0.75 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_133456
Gene ID 134549
Unigene ID Hs.519574
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000164403
GTEx ID ENSG00000164403

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_027917
ラット[1]  NM_027917

染色体

5q31.1  [132,157,833  -  132,166,590]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11853319
12477932
16615870
16684770

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0051017  actin filament bundle formation
GO:0000902  cell morphogenesis

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005874  microtubule
GO:0016460  myosin II complex

Molecular Function

GO:0051015  actin filament binding