cryptochrome 2 (photolyase-like)

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同義遺伝子名

cryptochrome 2 (photolyase-like), PHLL2, HCRY2, FLJ10332, KIAA0658, CRY2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:219.30

小脳:629.70

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:30.70

脊柱:224.60

網膜:118.60

目:146.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:18.20

脾臓:75.60

胸腺:128.80

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:76.80

皮膚:105.60

GeneChip

大脳:6.96

小脳:7.10

脳幹:6.76

脳梁:6.42

松果体:-

末梢神経:6.56

脊柱:6.45

網膜:-

目:-

動脈:7.03

静脈:7.29

リンパ節:6.42

末梢血:-

脾臓:6.39

胸腺:6.06

骨髄:6.19

脂肪:6.90

骨:-

皮膚:7.17

CAGE

大脳:3.88

小脳:-

脳幹:3.25

脳梁:3.60

松果体:4.81

末梢神経:-

脊柱:3.18

網膜:-

目:-

動脈:3.96

静脈:3.43

リンパ節:2.89

末梢血:-

脾臓:2.55

胸腺:2.54

骨髄:-

脂肪:3.71

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.35

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:227.80

胎盤:32.80

前立腺:78.90

卵巣:111.80

精巣:207.70

心臓:63.90

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:50.90

肝臓:95

肺:117.30

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:53.30

乳腺:120.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.65

胎盤:5.91

前立腺:6.77

卵巣:6.80

精巣:7.34

心臓:7.12

骨格筋:7.62

食道:6.50

胃:6.50

腸:6.29

結腸:6.28

肝臓:7.20

肺:6.70

膀胱:-

腎臓:6.87

下垂体:6.91

甲状腺:7.17

副腎:6.74

膵臓:5.96

乳腺:7.06

唾液腺:6.59

CAGE

子宮:3.68

胎盤:2.74

前立腺:3.54

卵巣:3.81

精巣:3.65

心臓:3.81

骨格筋:4.39

食道:3.11

胃:-

腸:2.89

結腸:3.07

肝臓:3.75

肺:3.45

膀胱:3.73

腎臓:3.00

下垂体:3.31

甲状腺:3.50

副腎:-

膵臓:2.90

乳腺:3.27

唾液腺:3.22

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.65

卵巣:3.79

精巣:3.61

心臓:2.90

骨格筋:3.89

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.56

肝臓:3.14

肺:3.45

膀胱:-

腎臓:2.30

下垂体:-

甲状腺:3.29

副腎:2.46

膵臓:-

乳腺:2.96

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001127457
Gene ID	1408
Unigene ID	Hs.532491
Probe set ID	212695_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000121671
GTEx ID	ENSG00000121671

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001113333, NM_009963
ラット [0]

染色体

11p11.2 [45,868,669 - 45,904,798]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0009785	blue light signaling pathway
GO:0007623	circadian rhythm
GO:0032515	negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0000719	photoreactive repair
GO:0018298	protein-chromophore linkage
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005576	extracellular region
GO:0005634	nucleus

GO:0009882	blue light photoreceptor activity
GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0003904	deoxyribodipyrimidine photo-lyase activity
GO:0003914	DNA (6-4) photolyase activity
GO:0003677	DNA binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0019902	phosphatase binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003697	single-stranded DNA binding

cryptochrome 2 (photolyase-like)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function