TruB pseudouridine (psi) synthase homolog 1 (E. coli)

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同義遺伝子名

PUS4, TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.21 小脳:- 脳幹:3.17 脳梁:2.87 松果体:3.05 末梢神経:- 脊柱:2.80 網膜:- 目:- 動脈:2.61 静脈:2.70 リンパ節:2.62 末梢血:- 脾臓:2.87 胸腺:2.98 骨髄:- 脂肪:2.52 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.63 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.44 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.67 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.69 胎盤:2.35 前立腺:2.97 卵巣:3.18 精巣:3.59 心臓:2.53 骨格筋:2.30 食道:2.80 胃:- 腸:2.42 結腸:2.60     肝臓:3.01    肺:2.50 膀胱:2.70 腎臓:3.26 下垂体:3.10 甲状腺:2.85 副腎:- 膵臓:2.66 乳腺:1.16 唾液腺:2.90
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.91 卵巣:3.52 精巣:4.18 心臓:2.73 骨格筋:1.73 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.34     肝臓:2.63        肺:1.66    膀胱:- 腎臓:3.40 下垂体:- 甲状腺:2.78 副腎:2.64 膵臓:- 乳腺:3.01 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_139169
Gene ID 142940
Unigene ID Hs.211870
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000165832
GTEx ID ENSG00000165832

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_028115, NM_029839
ラット[1]  NM_001012173, NM_029839

染色体

10q25.3  [116,697,952  -  116,737,430]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002501  Pseudouridine synthase II, TruB, N-terminal
IPR014780  Pseudouridine synthase II, TruB, N-terminal, bacterial-type
IPR020103  Pseudouridine synthase, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8125298
12477932
12736709
15164054
15489334
16385451
19471022
21139048
21145461
21832049
23940030
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001522  pseudouridine synthesis
GO:0008033  tRNA processing

Molecular Function

GO:0009982  pseudouridine synthase activity
GO:0003723  RNA binding