versican

同義遺伝子名

GHAP, DKFZp686K06110, Chondroitin sulfate proteoglycan core protein 2, VERSICAN, chondroitin sulfate proteoglycan 2 (versican), Versican core protein precursor, Large fibroblast proteoglycan, PG-M, Glial hyaluronate-binding protein, CSPG2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.67

小脳:5.38

脳幹:5.76

脳梁:6.86

松果体:-

末梢神経:5.02

脊柱:7.18

網膜:-

目:-

動脈:7.20

静脈:6.28

リンパ節:4.95

末梢血:-

脾臓:5

胸腺:4.71

骨髄:7

脂肪:5.75

骨:-

皮膚:6.14

CAGE

大脳:3.79

小脳:-

脳幹:3.89

脳梁:4.47

松果体:2.91

末梢神経:-

脊柱:4.51

網膜:-

目:-

動脈:6.01

静脈:3.93

リンパ節:3.35

末梢血:-

脾臓:4.44

胸腺:2.15

骨髄:-

脂肪:4.82

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.25

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.45

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.28

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:14.70

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.49

胎盤:7.50

前立腺:5

卵巣:5.71

精巣:4.57

心臓:6.55

骨格筋:4.80

食道:5.41

胃:5.84

腸:6.32

結腸:5.30

肝臓:4.63

肺:5.79

膀胱:-

腎臓:4.47

下垂体:4.53

甲状腺:4.77

副腎:6.78

膵臓:5.06

乳腺:5.89

唾液腺:4.63

CAGE

子宮:4.24

胎盤:5.00

前立腺:3.84

卵巣:3.34

精巣:3.39

心臓:5.20

骨格筋:3.37

食道:3.78

胃:-

腸:2.81

結腸:3.28

肝臓:2.14

肺:4.42

膀胱:4.72

腎臓:3.05

下垂体:1.90

甲状腺:3.24

副腎:-

膵臓:2.41

乳腺:4.05

唾液腺:1.82

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.46

卵巣:1.82

精巣:2.94

心臓:1.66

骨格筋:0.97

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.54

肝臓:0.78

肺:4.64

膀胱:-

腎臓:2.03

下垂体:-

甲状腺:1.30

副腎:2.99

膵臓:-

乳腺:2.93

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001126336
Gene ID	1462
Unigene ID	Hs.643801
Probe set ID	211571_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000038427
GTEx ID	ENSG00000038427

オーソログ対応遺伝子

マウス[20]	NM_001081249, NM_001134474, NM_001134475, NM_019389, NM_172955
ラット [0]

染色体

5q14.2 [82,767,284 - 82,878,122]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001304	C-type lectin
IPR016187	C-type lectin fold
IPR016186	C-type lectin-like
IPR001881	EGF-like calcium-binding
IPR000742	EGF-like, type 3
IPR000538	Link
IPR000436	Sushi/SCR/CCP

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0005975	carbohydrate metabolic process
GO:0007155	cell adhesion
GO:0008037	cell recognition
GO:0030206	chondroitin sulfate biosynthetic process
GO:0030207	chondroitin sulfate catabolic process
GO:0030204	chondroitin sulfate metabolic process
GO:0030208	dermatan sulfate biosynthetic process
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0008347	glial cell migration
GO:0030203	glycosaminoglycan metabolic process
GO:0007507	heart development
GO:0007275	multicellular organismal development

Cellular Component

GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space
GO:0005796	Golgi lumen
GO:0043202	lysosomal lumen
GO:0005578	proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005509	calcium ion binding
GO:0030246	carbohydrate binding
GO:0005539	glycosaminoglycan binding
GO:0005540	hyaluronic acid binding

versican

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function