ring finger and CCCH-type zinc finger domains 1

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同義遺伝子名

RP5-1198E17.5, Roquin, KIAA2025, RC3H1, RNF198, RING finger and C3H zinc finger protein 1, roquin, ring finger and CCCH-type zinc finger domains 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:11.90 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:30 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:64.40 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:19.20
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.99 小脳:- 脳幹:3.29 脳梁:3.34 松果体:3.15 末梢神経:- 脊柱:2.92 網膜:- 目:- 動脈:2.99 静脈:3.03 リンパ節:2.91 末梢血:- 脾臓:3.23 胸腺:3.27 骨髄:- 脂肪:3.10 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.63 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.59 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.57 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:21.90 前立腺:22.50 卵巣:37.30 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:60.30 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:-     肝臓:-        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:65.10 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.24 胎盤:2.95 前立腺:3.05 卵巣:2.65 精巣:2.86 心臓:2.73 骨格筋:3.12 食道:3.02 胃:- 腸:3.14 結腸:3.26     肝臓:2.73    肺:2.92 膀胱:2.83 腎臓:2.67 下垂体:3.11 甲状腺:2.99 副腎:- 膵臓:2.86 乳腺:2.27 唾液腺:2.93
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.06 卵巣:2.49 精巣:2.44 心臓:2.25 骨格筋:2.37 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.05     肝臓:1.90        肺:2.45    膀胱:- 腎臓:2.26 下垂体:- 甲状腺:2.59 副腎:2.79 膵臓:- 乳腺:3.17 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_172071
Gene ID 149041
Unigene ID Hs.30258
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000135870
GTEx ID ENSG00000135870

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001024952
ラット[1]  NM_001024952

染色体

1q25.1  [173,900,352  -  173,991,435]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
14702039
15917799
16710414
18172933
19217324
20412057
20467438
21844204
22685317
22939629
23550652
23583642
23663784
23825522
24550385
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0033962  cytoplasmic mRNA processing body assembly
GO:0046007  negative regulation of activated T cell proliferation
GO:0030889  negative regulation of B cell proliferation
GO:0002635  negative regulation of germinal center formation
GO:0045623  negative regulation of T-helper cell differentiation
GO:0000956  nuclear-transcribed mRNA catabolic process
GO:0010608  posttranscriptional regulation of gene expression
GO:0002634  regulation of germinal center formation
GO:0043488  regulation of mRNA stability
GO:0050856  regulation of T cell receptor signaling pathway

Cellular Component

GO:0000932  cytoplasmic mRNA processing body
GO:0010494  stress granule

Molecular Function

GO:0003730  mRNA 3'-UTR binding
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding