DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 8

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

ATP-dependent RNA helicase DHX8, PRP22, DEAH box protein 8, PRPF22, DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 8, RNA helicase HRH1, DDX8, DHX8

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:42.70 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:- 目:35.30 動脈:119.90 静脈:133.30 リンパ節:161.80 末梢血:54.70 脾臓:- 胸腺:90.20 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:43.20
GeneChip 大脳:5.29 小脳:5.22 脳幹:5.30 脳梁:5.25 松果体:- 末梢神経:5.81 脊柱:5.23 網膜:- 目:- 動脈:5.87 静脈:5.61 リンパ節:5.99 末梢血:- 脾臓:5.99 胸腺:6.72 骨髄:6.21 脂肪:5.83 骨:- 皮膚:6.33
CAGE 大脳:3.28 小脳:- 脳幹:3.39 脳梁:3.51 松果体:3.50 末梢神経:- 脊柱:3.29 網膜:- 目:- 動脈:3.27 静脈:3.32 リンパ節:3.20 末梢血:- 脾臓:3.38 胸腺:3.78 骨髄:- 脂肪:3.40 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.37 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.94 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.22 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:100.20 胎盤:51 前立腺:22.50 卵巣:37.30 精巣:108.20 心臓:51.10 骨格筋:40.20 食道:- 胃:- 腸:97.20 結腸:59.40     肝臓:52.80        肺:78.20    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:62.20 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.97 胎盤:6.12 前立腺:6.02 卵巣:5.91 精巣:6.67 心臓:5.33 骨格筋:5.51 食道:6.20 胃:5.48 腸:5.52 結腸:5.71 肝臓:5.38 肺:5.84 膀胱:- 腎臓:5.53 下垂体:5.61 甲状腺:5.67 副腎:5.28 膵臓:4.99 乳腺:6.37 唾液腺:5.64
CAGE 子宮:3.38 胎盤:3.26 前立腺:3.03 卵巣:3.25 精巣:3.79 心臓:3.00 骨格筋:3.34 食道:3.20 胃:- 腸:3.34 結腸:3.33     肝臓:3.12    肺:3.06 膀胱:3.03 腎臓:3.17 下垂体:3.24 甲状腺:3.13 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:3.02 唾液腺:3.37
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.16 卵巣:3.22 精巣:3.42 心臓:2.18 骨格筋:3.12 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.50     肝臓:2.24        肺:2.64    膀胱:- 腎臓:2.82 下垂体:- 甲状腺:3.36 副腎:3.32 膵臓:- 乳腺:2.70 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004941
Gene ID 1659
Unigene ID Hs.463105
Probe set ID 203334_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000067596
GTEx ID ENSG00000067596

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_144831
ラット [0]  

染色体

17q21.31  [41,561,331  -  41,604,154]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR012340  Nucleic acid-binding, OB-fold
IPR016027  Nucleic acid-binding, OB-fold-like
IPR003029  Ribosomal protein S1, RNA binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7935475
8608946
11991638
12477932
15635413
16094384
16820410
18029348
18729074
19615732
19724143
21139048
21145461
22365833
22404213
22586326
22939629
23022380
23096351
23602568
23771891
23824909
24778252
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0006396  RNA processing
GO:0008380  RNA splicing

Cellular Component

GO:0071013  catalytic step 2 spliceosome
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus
GO:0005681  spliceosomal complex

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0004004  ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding