aggrecan

同義遺伝子名

AGC1, MSK16, Cartilage-specific proteoglycan core protein, CSPG1, SEDK, CSPCP, Aggrecan core protein precursor, CSPGCP, Chondroitin sulfate proteoglycan core protein 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:27.30

小脳:63

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:17.60

動脈:60

静脈:66.60

リンパ節:20.20

末梢血:36.40

脾臓:-

胸腺:25.80

骨髄:39.40

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:38.40

GeneChip

大脳:6.11

小脳:4.97

脳幹:6.09

脳梁:6.65

松果体:-

末梢神経:7.50

脊柱:6.45

網膜:-

目:-

動脈:7.71

静脈:8.39

リンパ節:5.44

末梢血:-

脾臓:6.57

胸腺:4.04

骨髄:4.34

脂肪:7.55

骨:-

皮膚:6.14

CAGE

大脳:0.90

小脳:-

脳幹:1.09

脳梁:1.23

松果体:0.56

末梢神経:-

脊柱:1.22

網膜:-

目:-

動脈:4.69

静脈:0.70

リンパ節:0.06

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0.14

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:14.60

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:21.60

心臓:12.80

骨格筋:20.10

食道:342.80

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:31.70

肺:14.70

膀胱:125.60

腎臓:-

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:37.20

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.71

胎盤:6.81

前立腺:7.12

卵巣:7.07

精巣:5.32

心臓:7.12

骨格筋:5.93

食道:6.13

胃:6.86

腸:5.85

結腸:5.95

肝臓:7.28

肺:7.35

膀胱:-

腎臓:6.89

下垂体:5.74

甲状腺:6.53

副腎:6.44

膵臓:5.16

乳腺:7.15

唾液腺:5.96

CAGE

子宮:1.83

胎盤:0.88

前立腺:1.09

卵巣:0.79

精巣:1.13

心臓:0.95

骨格筋:0.72

食道:0.40

胃:-

腸:0.14

結腸:0.53

肝臓:0

肺:0.79

膀胱:1.56

腎臓:1.67

下垂体:0.24

甲状腺:0.49

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0.55

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.17

卵巣:0.04

精巣:0

心臓:0.00

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.07

肝臓:0

肺:0

膀胱:-

腎臓:0.06

下垂体:-

甲状腺:0.14

副腎:0.11

膵臓:-

乳腺:0

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001135000
Gene ID	176
Unigene ID	Hs.21590
Probe set ID	214212_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000073712
GTEx ID	ENSG00000073712

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_146054
ラット [0]

染色体

15q26.1 [89,346,674 - 89,418,585]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001304	C-type lectin
IPR016187	C-type lectin fold
IPR016186	C-type lectin-like
IPR000742	EGF-like, type 3
IPR013106	Immunoglobulin V-set
IPR003596	Immunoglobulin V-set, subgroup
IPR000538	Link
IPR000436	Sushi/SCR/CCP

GO:0005975	carbohydrate metabolic process
GO:0007155	cell adhesion
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0030203	glycosaminoglycan metabolic process
GO:0018146	keratan sulfate biosynthetic process
GO:0042340	keratan sulfate catabolic process
GO:0042339	keratan sulfate metabolic process
GO:0006508	proteolysis
GO:0001501	skeletal system development

GO:0031012	extracellular matrix
GO:0005576	extracellular region
GO:0005796	Golgi lumen
GO:0043202	lysosomal lumen
GO:0005578	proteinaceous extracellular matrix

GO:0030246	carbohydrate binding
GO:0005201	extracellular matrix structural constituent
GO:0005540	hyaluronic acid binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding

aggrecan

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function