aprataxin and PNKP like factor

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同義遺伝子名

Uncharacterized protein C2orf13, C2orf13, chromosome 2 open reading frame 13, MGC47799

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:13 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.01 小脳:- 脳幹:1.26 脳梁:0.94 松果体:1.72 末梢神経:- 脊柱:1.52 網膜:- 目:- 動脈:1.61 静脈:0.88 リンパ節:1.48 末梢血:- 脾臓:1.56 胸腺:1.31 骨髄:- 脂肪:1.33 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.23 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.61 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.99 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:18.20 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:21.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:10.60        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.83 胎盤:1.37 前立腺:1.95 卵巣:1.20 精巣:1.41 心臓:1.38 骨格筋:1.20 食道:2.01 胃:- 腸:1.20 結腸:1.82     肝臓:0.55    肺:1.15 膀胱:1.64 腎臓:1.21 下垂体:1.47 甲状腺:1.23 副腎:- 膵臓:1.21 乳腺:1.80 唾液腺:1.00
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.14 卵巣:0.75 精巣:1.53 心臓:0.44 骨格筋:0.41 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.01     肝臓:0.25        肺:0.52    膀胱:- 腎臓:0.54 下垂体:- 甲状腺:0.80 副腎:0.72 膵臓:- 乳腺:1.11 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_173545
Gene ID 200558
Unigene ID Hs.258941
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000169621
GTEx ID ENSG00000169621

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001170489, NM_024251
ラット [0]  

染色体

2p13.3  [68,694,693  -  68,858,004]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
14702039
15489334
15815621
16344560
17353262
17396150
17507382
18077224
18172500
18474613
19155274
19661379
20098424
21211721
21211722
21414327
21832049
21885877
22190364
23178593
23689425
23940030
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006302  double-strand break repair
GO:0006974  response to DNA damage stimulus
GO:0000012  single strand break repair

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0008408  3'-5' exonuclease activity
GO:0003906  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase activity
GO:0004520  endodeoxyribonuclease activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding