excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 (xeroderma pigmentosum group B complementing)

同義遺伝子名

ERCC3, DNA-repair protein complementing XP-B cells, XPBC, BTF2-p89, GTF2H, Basic transcription factor 2 89 kDa subunit, RAD25, XPB, DNA excision repair protein ERCC-3, TFIIH 89 kDa subunit

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:190.80

小脳:201.50

脳幹:-

脳梁:233.30

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:224.60

網膜:-

目:35.30

動脈:149.90

静脈:133.30

リンパ節:161.80

末梢血:36.40

脾臓:151.30

胸腺:270.60

骨髄:98.40

脂肪:201.70

骨:51.20

皮膚:72

GeneChip

大脳:6.63

小脳:6.98

脳幹:6.66

脳梁:6.67

松果体:-

末梢神経:6.61

脊柱:6.33

網膜:-

目:-

動脈:6.24

静脈:5.80

リンパ節:6.79

末梢血:-

脾臓:6.87

胸腺:7.27

骨髄:6.25

脂肪:6.45

骨:-

皮膚:6.40

CAGE

大脳:3.44

小脳:-

脳幹:3.33

脳梁:3.31

松果体:3.21

末梢神経:-

脊柱:3.14

網膜:-

目:-

動脈:3.31

静脈:3.35

リンパ節:2.95

末梢血:-

脾臓:3.12

胸腺:3.28

骨髄:-

脂肪:2.90

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.19

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.81

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.46

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:18.20

前立腺:202.80

卵巣:-

精巣:151.40

心臓:76.60

骨格筋:40.20

食道:-

胃:21.20

腸:97.20

結腸:8.50

肝臓:31.70

肺:78.20

膀胱:376.80

腎臓:135.20

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:152.40

膵臓:26.70

乳腺:27.90

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:6.80

胎盤:6.16

前立腺:6.69

卵巣:6.89

精巣:7.45

心臓:5.93

骨格筋:6.39

食道:6.40

胃:6.28

腸:6.15

結腸:6.04

肝臓:5.94

肺:6.54

膀胱:-

腎臓:6.11

下垂体:6.86

甲状腺:6.65

副腎:6.46

膵臓:6.14

乳腺:6.70

唾液腺:6.11

CAGE

子宮:3.33

胎盤:2.90

前立腺:3.22

卵巣:3.00

精巣:3.87

心臓:2.96

骨格筋:3.24

食道:2.90

胃:-

腸:2.69

結腸:2.80

肝臓:2.93

肺:2.98

膀胱:2.87

腎臓:2.90

下垂体:3.32

甲状腺:2.83

副腎:-

膵臓:3.02

乳腺:2.91

唾液腺:3.17

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.92

卵巣:3.51

精巣:4.53

心臓:2.66

骨格筋:3.18

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.71

肝臓:2.77

肺:2.37

膀胱:-

腎臓:3.21

下垂体:-

甲状腺:3.52

副腎:3.70

膵臓:-

乳腺:3.05

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000122
Gene ID	2071
Unigene ID	Hs.469872
Probe set ID	202176_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000163161
GTEx ID	ENSG00000163161

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_133658
ラット[1]	NM_001031644

染色体

2q14.3 [128,014,866 - 128,051,752]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0000075	cell cycle checkpoint
GO:0006281	DNA repair
GO:0006265	DNA topological change
GO:0010467	gene expression
GO:0035315	hair cell differentiation
GO:0006917	induction of apoptosis
GO:0006370	mRNA capping
GO:0006289	nucleotide-excision repair
GO:0000718	nucleotide-excision repair, DNA damage removal
GO:0000717	nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding
GO:0033683	nucleotide-excision repair, DNA incision
GO:0043065	positive regulation of apoptosis
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0050434	positive regulation of viral transcription
GO:0008104	protein localization
GO:0001666	response to hypoxia
GO:0006979	response to oxidative stress
GO:0009411	response to UV
GO:0006362	RNA elongation from RNA polymerase I promoter
GO:0006368	RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0006363	termination of RNA polymerase I transcription
GO:0006360	transcription from RNA polymerase I promoter
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006361	transcription initiation from RNA polymerase I promoter
GO:0006367	transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0006283	transcription-coupled nucleotide-excision repair
GO:0009650	UV protection
GO:0016032	viral reproduction
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005675	holo TFIIH complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0000441	SSL2-core TFIIH complex

Molecular Function

GO:0043138	3'-5' DNA helicase activity
GO:0005524	ATP binding
GO:0004003	ATP-dependent DNA helicase activity
GO:0016887	ATPase activity
GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0032564	dATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0008094	DNA-dependent ATPase activity
GO:0005525	GTP binding
GO:0042277	peptide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding
GO:0004672	protein kinase activity
GO:0047485	protein N-terminus binding
GO:0008353	RNA polymerase II carboxy-terminal domain kinase activity
GO:0008134	transcription factor binding

excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 (xeroderma pigmentosum group B complementing)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function