excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4

同義遺伝子名

ERCC4, DNA-repair protein complementing XP-F cells, DNA excision repair protein ERCC-4, DNA repair endonuclease XPF, ERCC11, XPF

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:8.30

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:17.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:40.40

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:9.60

GeneChip

大脳:6.11

小脳:5.98

脳幹:6.08

脳梁:6.27

松果体:-

末梢神経:6.09

脊柱:6.38

網膜:-

目:-

動脈:5.89

静脈:6.11

リンパ節:5.96

末梢血:-

脾臓:5.89

胸腺:5.77

骨髄:6.26

脂肪:5.95

骨:-

皮膚:5.81

CAGE

大脳:2.83

小脳:-

脳幹:2.96

脳梁:2.90

松果体:3.10

末梢神経:-

脊柱:3.05

網膜:-

目:-

動脈:2.46

静脈:2.52

リンパ節:2.44

末梢血:-

脾臓:2.55

胸腺:3.03

骨髄:-

脂肪:2.77

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.78

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.80

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.14

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:14.60

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:73.50

心臓:-

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:10.60

肺:-

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:-

乳腺:65.10

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.85

胎盤:6.41

前立腺:5.66

卵巣:6.04

精巣:6.73

心臓:6.26

骨格筋:6.07

食道:5.84

胃:6.05

腸:6.06

結腸:6.06

肝臓:6.02

肺:5.85

膀胱:-

腎臓:5.97

下垂体:6.34

甲状腺:5.96

副腎:6.14

膵臓:6.51

乳腺:6.01

唾液腺:6.07

CAGE

子宮:2.78

胎盤:2.41

前立腺:2.60

卵巣:2.79

精巣:3.06

心臓:2.54

骨格筋:2.70

食道:2.36

胃:-

腸:2.10

結腸:2.34

肝臓:2.37

肺:2.44

膀胱:2.66

腎臓:2.46

下垂体:3.13

甲状腺:2.46

副腎:-

膵臓:2.34

乳腺:2.19

唾液腺:2.46

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.71

卵巣:2.38

精巣:2.15

心臓:1.59

骨格筋:1.78

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.19

肝臓:1.07

肺:0.64

膀胱:-

腎臓:1.53

下垂体:-

甲状腺:1.55

副腎:1.54

膵臓:-

乳腺:1.51

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005236
Gene ID	2072
Unigene ID	Hs.567265
Probe set ID	210158_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000175595
GTEx ID	ENSG00000175595

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_015769
ラット[2]	NM_015769

染色体

16p13.12 [14,014,014 - 14,046,205]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006166	ERCC4 domain
IPR011335	Restriction endonuclease, type II-like, core

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006281	DNA repair
GO:0000724	double-strand break repair via homologous recombination
GO:0000710	meiotic mismatch repair
GO:0032205	negative regulation of telomere maintenance
GO:0006289	nucleotide-excision repair
GO:0000718	nucleotide-excision repair, DNA damage removal
GO:0033683	nucleotide-excision repair, DNA incision
GO:0006295	nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion
GO:0006296	nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion
GO:0000712	resolution of meiotic recombination intermediates
GO:0009411	response to UV
GO:0000723	telomere maintenance
GO:0010834	telomere maintenance via telomere shortening
GO:0006283	transcription-coupled nucleotide-excision repair
GO:0009650	UV protection

Cellular Component

GO:0000781	chromosome, telomeric region
GO:0000784	nuclear chromosome, telomeric region
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0000109	nucleotide-excision repair complex
GO:0000110	nucleotide-excision repair factor 1 complex
GO:0005634	nucleus
GO:0005669	transcription factor TFIID complex

Molecular Function

GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0004520	endodeoxyribonuclease activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding
GO:0047485	protein N-terminus binding
GO:0003697	single-stranded DNA binding
GO:0000014	single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease activity
GO:0043566	structure-specific DNA binding

excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function