excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6

同義遺伝子名

COFS, RAD26, ERCC6, Cockayne syndrome protein CSB, DNA excision repair protein ERCC-6, CSB, ATP-dependent helicase ERCC6, CKN2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.51

小脳:4.46

脳幹:4.48

脳梁:4.59

松果体:-

末梢神経:4.54

脊柱:4.62

網膜:-

目:-

動脈:4.92

静脈:4.57

リンパ節:4.69

末梢血:-

脾臓:4.58

胸腺:4.77

骨髄:4.62

脂肪:4.47

骨:-

皮膚:4.50

CAGE

nodata

RNA-seq

大脳:1.02

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.16

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.93

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:4.62

胎盤:4.28

前立腺:4.67

卵巣:4.66

精巣:5.49

心臓:4.54

骨格筋:4.56

食道:4.55

胃:4.58

腸:4.54

結腸:4.43

肝臓:4.66

肺:4.41

膀胱:-

腎臓:4.46

下垂体:4.83

甲状腺:4.76

副腎:4.58

膵臓:4.53

乳腺:4.67

唾液腺:4.70

CAGE

nodata

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.58

卵巣:1.12

精巣:1.83

心臓:1.27

骨格筋:1.45

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.20

肝臓:0.66

肺:0.79

膀胱:-

腎臓:1.35

下垂体:-

甲状腺:1.60

副腎:1.00

膵臓:-

乳腺:1.03

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000124
Gene ID	2074
Unigene ID	-
Probe set ID	207347_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000225830
GTEx ID	ENSG00000225830

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_001081221
ラット[1]	NM_001107296

染色体

10q11.23 [50,663,414 - 50,747,584]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007256	activation of JNKK activity
GO:0007257	activation of JUN kinase activity
GO:0006284	base-excision repair
GO:0008630	DNA damage response, signal transduction resulting in induction of apoptosis
GO:0006281	DNA repair
GO:0035264	multicellular organism growth
GO:0006289	nucleotide-excision repair
GO:0045494	photoreceptor cell maintenance
GO:0032786	positive regulation of RNA elongation
GO:0006290	pyrimidine dimer repair
GO:0032784	regulation of RNA elongation
GO:0010332	response to gamma radiation
GO:0006979	response to oxidative stress
GO:0000303	response to superoxide
GO:0009636	response to toxin
GO:0009411	response to UV
GO:0010224	response to UV-B
GO:0010165	response to X-ray
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006283	transcription-coupled nucleotide-excision repair

Cellular Component

GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0008023	transcription elongation factor complex

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003678	DNA helicase activity
GO:0008094	DNA-dependent ATPase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding
GO:0032403	protein complex binding
GO:0047485	protein N-terminus binding

excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function