smoothelin-like 1

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同義遺伝子名

CHASM, smoothelin-like 1, SMTNL1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:1.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:9.60
GeneChip nodata
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:0.26 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.02 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.04 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:38.30 骨格筋:281.30 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:42.20        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.03 卵巣:0.13 精巣:0.87 心臓:0.04 骨格筋:6.37 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0.11        肺:0.18    膀胱:- 腎臓:0.11 下垂体:- 甲状腺:2.61 副腎:0.40 膵臓:- 乳腺:2.48 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001105565
Gene ID 219537
Unigene ID Hs.68756
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000214872
GTEx ID ENSG00000214872

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_024230
ラット [0]  

染色体

11q12.1  [57,308,979  -  57,318,108]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016146  Calponin-homology
IPR001715  Calponin-like actin-binding

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889549
15327999
18310078
20634291
21352594

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045908  negative regulation of vasodilation
GO:0045907  positive regulation of vasoconstriction

Cellular Component

GO:0043292  contractile fiber
GO:0005737  cytoplasm
GO:0031674  I band
GO:0031430  M band
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005516  calmodulin binding