jumonji domain containing 1C

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同義遺伝子名

jumonji domain containing 1C, JMJD1C, Jumonji domain-containing protein 1C, Thyroid receptor-interacting protein 8, TRIP-8, TRIP8, DKFZp761F0118, KIAA1380, FLJ14374, thyroid hormone receptor interactor 8, JHDM2C, RP11-10C13.2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:124.40 小脳:125.90 脳幹:- 脳梁:- 松果体:741.70 末梢神経:122.70 脊柱:112.30 網膜:118.60 目:135.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:202.20 末梢血:72.90 脾臓:37.80 胸腺:64.40 骨髄:118.10 脂肪:40.30 骨:25.60 皮膚:259.20
GeneChip 大脳:6.50 小脳:7.83 脳幹:6.66 脳梁:6.72 松果体:- 末梢神経:6.82 脊柱:6.74 網膜:- 目:- 動脈:6.87 静脈:7.07 リンパ節:7.22 末梢血:- 脾臓:7.36 胸腺:7.67 骨髄:5.96 脂肪:7.02 骨:- 皮膚:6.94
CAGE 大脳:3.27 小脳:- 脳幹:3.51 脳梁:2.83 松果体:4.56 末梢神経:- 脊柱:4.04 網膜:- 目:- 動脈:3.86 静脈:4.06 リンパ節:3.90 末梢血:- 脾臓:4.29 胸腺:4.09 骨髄:- 脂肪:4.44 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.63 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.64 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.95 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:136.70 胎盤:138.40 前立腺:33.80 卵巣:37.30 精巣:82.20 心臓:114.90 骨格筋:- 食道:- 胃:1529.40 腸:64.80 結腸:144.20     肝臓:158.30        肺:117.30    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:116 甲状腺:163.70 副腎:101.60 膵臓:133.40 乳腺:427.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.98 胎盤:7.01 前立腺:7.69 卵巣:7.75 精巣:6.78 心臓:6.75 骨格筋:6.45 食道:6.42 胃:6.40 腸:6.60 結腸:5.67 肝臓:7.09 肺:7.33 膀胱:- 腎臓:6.07 下垂体:6.42 甲状腺:7.22 副腎:6.69 膵臓:5.43 乳腺:7.26 唾液腺:6.44
CAGE 子宮:4.03 胎盤:3.06 前立腺:3.71 卵巣:3.81 精巣:3.60 心臓:3.60 骨格筋:3.21 食道:3.81 胃:- 腸:4.08 結腸:3.35     肝臓:3.64    肺:4.29 膀胱:4.07 腎臓:3.60 下垂体:3.72 甲状腺:3.52 副腎:- 膵臓:2.66 乳腺:3.62 唾液腺:3.24
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.16 卵巣:1.32 精巣:1.11 心臓:1.40 骨格筋:0.96 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.86     肝臓:1.23        肺:2.68    膀胱:- 腎臓:2.22 下垂体:- 甲状腺:2.18 副腎:2.06 膵臓:- 乳腺:1.91 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_004241
Gene ID 221037
Unigene ID Hs.413416
Probe set ID 221763_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000171988
GTEx ID ENSG00000171988

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001242396, NM_207221
ラット [0]  

染色体

10q21.3  [64,926,981  -  65,225,722]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7776974
10718198
11500849
12477932
14533015
14702039
16385451
17290275
17353003
17353931
17549425
18940312
19820697
19936222
20379614
20526338
20648472
20686565
21139048
21900206
22001757
22139419
22354554
22423221
22829776
22890011
22936694
23263863
23455924
23593242
23969696
24026423
24097068
24240613
24318875
24501218

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007596  blood coagulation
GO:0016568  chromatin modification
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005622  intracellular
GO:0005654  nucleoplasm

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0005515  protein binding
GO:0046966  thyroid hormone receptor binding