chondroitin sulfate synthase 1

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同義遺伝子名

KIAA0990, CSS1, CHSY, UNQ756/PRO1487, N-acetylgalactosaminyltransferase II, Chondroitin sulfate synthase 1, CHSY1, carbohydrate (chondroitin) synthase 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:4.70 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:118.60 目:29.40 動脈:119.90 静脈:- リンパ節:60.70 末梢血:36.40 脾臓:56.70 胸腺:38.70 骨髄:216.50 脂肪:- 骨:51.20 皮膚:105.60
GeneChip 大脳:5.71 小脳:5.78 脳幹:5.66 脳梁:6.22 松果体:- 末梢神経:7.24 脊柱:6.42 網膜:- 目:- 動脈:7.71 静脈:8.21 リンパ節:6.96 末梢血:- 脾臓:7.58 胸腺:6.99 骨髄:7.71 脂肪:6.96 骨:- 皮膚:7.14
CAGE 大脳:3.20 小脳:- 脳幹:3.38 脳梁:3.24 松果体:2.90 末梢神経:- 脊柱:3.52 網膜:- 目:- 動脈:4.30 静脈:3.48 リンパ節:3.27 末梢血:- 脾臓:3.80 胸腺:2.92 骨髄:- 脂肪:4.05 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.99 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.22 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:82 胎盤:265.90 前立腺:45.10 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:38.30 骨格筋:40.20 食道:- 胃:63.70 腸:- 結腸:42.40     肝臓:-        肺:24.40    膀胱:125.60 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:44.50 乳腺:65.10 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.77 胎盤:9.62 前立腺:7.87 卵巣:7.42 精巣:6.80 心臓:6.75 骨格筋:5.63 食道:6.29 胃:6.97 腸:6.84 結腸:6.22 肝臓:6.06 肺:8.05 膀胱:- 腎臓:6.18 下垂体:6.35 甲状腺:6.63 副腎:7.75 膵臓:5.77 乳腺:7.52 唾液腺:6.83
CAGE 子宮:3.74 胎盤:5.07 前立腺:3.56 卵巣:3.98 精巣:3.56 心臓:3.61 骨格筋:2.82 食道:3.03 胃:- 腸:2.76 結腸:2.94     肝臓:2.69    肺:3.78 膀胱:3.54 腎臓:2.82 下垂体:3.11 甲状腺:2.85 副腎:- 膵臓:2.26 乳腺:3.49 唾液腺:3.17
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.49 卵巣:4.53 精巣:4.35 心臓:2.79 骨格筋:2.16 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.36     肝臓:2.03        肺:5.40    膀胱:- 腎臓:3.09 下垂体:- 甲状腺:2.89 副腎:4.47 膵臓:- 乳腺:3.71 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_014918
Gene ID 22856
Unigene ID Hs.110488
Probe set ID 203044_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000131873
GTEx ID ENSG00000131873

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001081163
ラット[1]  NM_001106268

染色体

15q26.3  [101,715,928  -  101,792,137]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10231032
11514575
12477932
12716890
12907687
12975309
15489334
16303743
19322201
19946888
21129727
21129728
21468578
23291589
23322567
23811343
24068947

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0005975  carbohydrate metabolic process
GO:0030206  chondroitin sulfate biosynthetic process
GO:0030204  chondroitin sulfate metabolic process
GO:0030203  glycosaminoglycan metabolic process
GO:0030279  negative regulation of ossification
GO:0031667  response to nutrient levels

Cellular Component

GO:0005576  extracellular region
GO:0032580  Golgi cisterna membrane
GO:0000139  Golgi membrane
GO:0016021  integral to membrane

Molecular Function

GO:0047238  glucuronosyl-N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0046872  metal ion binding
GO:0050510  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase activity