lysine (K)-specific demethylase 2A

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同義遺伝子名

KIAA1004, FLJ00115, FBL7, DKFZP434M1735, CXXC8, LILINA, F-box protein FBL7, F-box/LRR-repeat protein 11, FLJ46431, F-box and leucine-rich repeat protein 11, JHDM1A, FBXL11, F-box protein Lilina, FBL11

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:56.90 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:112.30 網膜:- 目:182.20 動脈:30 静脈:133.30 リンパ節:121.30 末梢血:145.70 脾臓:75.60 胸腺:51.50 骨髄:334.60 脂肪:80.70 骨:64 皮膚:211.20
GeneChip 大脳:7.68 小脳:7.94 脳幹:7.56 脳梁:7.65 松果体:- 末梢神経:7.92 脊柱:7.51 網膜:- 目:- 動脈:8.01 静脈:8.12 リンパ節:8.81 末梢血:- 脾臓:9.14 胸腺:8.34 骨髄:7.99 脂肪:7.96 骨:- 皮膚:8.10
CAGE 大脳:3.72 小脳:- 脳幹:3.64 脳梁:3.64 松果体:3.88 末梢神経:- 脊柱:3.50 網膜:- 目:- 動脈:3.95 静脈:4.05 リンパ節:4.21 末梢血:- 脾臓:4.02 胸腺:4.01 骨髄:- 脂肪:3.48 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.82 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.24 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.84 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:127.60 胎盤:91.10 前立腺:22.50 卵巣:74.50 精巣:69.20 心臓:89.40 骨格筋:40.20 食道:- 胃:127.50 腸:- 結腸:144.20     肝臓:42.20        肺:68.40    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:232 甲状腺:163.70 副腎:- 膵臓:71.10 乳腺:139.40 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.09 胎盤:7.93 前立腺:7.96 卵巣:8.17 精巣:8.55 心臓:7.98 骨格筋:7.59 食道:8.94 胃:8.38 腸:7.82 結腸:8.11 肝臓:8.70 肺:8.33 膀胱:- 腎臓:8.27 下垂体:7.74 甲状腺:8.24 副腎:8.34 膵臓:7.41 乳腺:8.52 唾液腺:8.08
CAGE 子宮:3.86 胎盤:3.89 前立腺:3.62 卵巣:3.56 精巣:3.67 心臓:3.54 骨格筋:3.27 食道:3.82 胃:- 腸:3.57 結腸:3.59     肝臓:3.29    肺:3.62 膀胱:3.87 腎臓:3.46 下垂体:3.76 甲状腺:3.66 副腎:- 膵臓:3.37 乳腺:3.35 唾液腺:3.76
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:3.32 精巣:1.65 心臓:1.96 骨格筋:2.06 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.22     肝臓:0.00        肺:0.03    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:3.24 副腎:1.08 膵臓:- 乳腺:2.30 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_012308
Gene ID 22992
Unigene ID Hs.124147
Probe set ID 208987_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000173120
GTEx ID ENSG00000173120

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001001984
ラット[1]  NM_001108515

染色体

11q13.2  [66,886,740  -  67,025,141]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787  Zinc finger, PHD-finger
IPR001965  Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10231032
10531035
10531037
10945468
11214971
12168954
12477932
14702039
15070733
15231748
15489334
15635413
16147992
16362057
17081983
17463251
19001877
19322201
19805303
19850743
20080798
20379134
20417597
20682791
20936779
21029866
21139048
21187428
21251613
21609845
21890473
21988832
22083960
22100412
22635273
23074094
23537643
23559091
24200691
24457600
24482232

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0070544  histone H3-K36 demethylation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005654  nucleoplasm

Molecular Function

GO:0051864  histone demethylase activity (H3-K36 specific)
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0045322  unmethylated CpG binding
GO:0008270  zinc ion binding